鸭RIG-1启动子克隆、序列分析及在鸭胚胎期发育性表达-期刊.pdfVIP

浙江大学学报(农业与生命科学版) JournalofZhejiangUniversity(Agric．＆ LifeSci．) http ff ．zjuiournals．com／agr E—mail：zdxbnsb@zju．edu．cn DOI：10．3785／j．issn．1008—9209．2016．06．031 鸭RIG-1启动子克隆、序列分析及在鸭胚胎期发育性表达 罗俊，刘贺贺 ，刘俊莹，张涛 ，王郁石，韩春春 (四川农业大学动物遗传育种研究所 ，四川 温江 611130) 摘要 RICrl属于细胞 内蛋白。与细胞增殖、分化和天然抗免疫功能密切相关。为研究RI l在鸭胚胎期免疫器 官发育中的作用，本研究克隆得到鸭Rjpj启动子并做生物信息学分析。应用实时荧光定量PCR技术检测 RIG-1 基 因以及预测得到的多个转录因子在鸭胚胎免疫器官发育过程 中的表达模式。结果表明，扩增得到鸭 RfGj基 因 启动子4372bp。序列分析表 明。该基 因启动子存在典型的 TATA—box、CAAT-box调控元件 ，有 IRF-1、RxR、 RAR、AP1、NFKB、SPI、IL6及 Pax-2等多个转录因子结合位点。此外，RjG-1启动子预测发现 了一个 CpG 岛，Gc 舍量 65．8 。定量结果发现 。RjG1在鸭胚胎免疫器官中表达呈动态性，具有不 同的表达模式；并在法氏囊 中的表 达量高于脾脏和胸腺 。聚类热图显示 ，只有在法氏囊 中Rj j与 IRF_1、RxR、AP1、NF～KB、II6的mRNA表达量 具有相似的表达模式。这可能是由于在鸭胚胎期法氏囊具有较为完整的结构与功能，暗示它们可能为RfGl的转 录因子；而在法氏囊、脾脏和胸腺 中，Rf j与JRF—j、NF一 基因都有较为相似的表达模式，在 3个组织当中均被 聚类在一起 ，说 明IRF_1和 NF-KB可能参与调控 RjG-1的表达。研究结果为探索鸭 R，Gj基 因转录调控 、表达 ， 与在细胞增殖 、分化 、天然抗病毒免疫方面的功能提供 了依据和方向。 关键词 RIG 1；启动子 ；鸭 ；免疫 中图分类号 S834 文献标志码 A Molecularcloning，bioinformaticsoftheduckRIG-1promoterregionlanditsdifferentialexpression profilesin embryostages．JournalofZhejiangUniversity (Agric． Li／eSci．)，2017，43(1)：104—112 LUO Jun，LIU Hehe ，LIU Junying，ZHANG Tao，WANG Yushi，HAN Chunehun (InstituteoJ、Animal GeneticsandBreeding，SichuanAgriculturalUniversity，Wenjiang611130．Sichuan，China) Summary Theretinoicacid induciblegene-1一likereceptors(RLRs)playan importantrolein innateimmune system．RIG-1。asamemberofRIRs。belongstointracellularproteinandiscloselyrelatedtocellproliferation， differentiati0nandinnateantiviralimmunity．Itiswidely accepted thattheRIG-1 isabsentin chicken genome， whereasexistsintheduck’S。whichmayaccountforthestrongerabilitiesofwaterfowlthanchickenin antivirus． Promoter，asthecentralelementofgeneexpression regulation，can affectgenefunction by regulating mRNA transcr