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噬菌体展示技术操作步骤
筛选多肽
试剂及配制
LB培养基:
胰蛋白胨 10g
酵母提取物 5g
NaCl 5g
溶于去离子水,至1L,高压灭菌,4℃保存。
IPTG/Xgal:
称取1.25g IPTG,1.0g Xgal,溶于二甲基甲酰胺,至总体积25ml,-20℃避光保存。
LB/IPTG/Xgal平板:
1L LB培养基+15g琼脂粉,高压灭菌,冷却至70℃以下,加入1ml IPTG/Xgal,立即铺板,4℃避光保存。
顶层琼脂糖凝胶:
胰蛋白胨 10g
酵母提取物 5g
NaCl 5g
MgCl2.6H2O 1g
琼脂糖 7g
溶于适量去离子水中,至总体积为1L。高压灭菌,分装为50ml/份,室温保存,使用时于微波炉内融化。
2×M9盐:
Na2HPO4 12g
KH2PO4 6g
NaCl 1g
NH4Cl 2g
溶于适量去离子水中,至终体积为1L。
小型平板:
500ml 2×M9盐
500ml 3%琼脂粉
20ml 20%葡萄糖
2ml 1M MgSO4
0.1ml 1M CaCl2
1ml 硫胺素(10mg/ml)
在混合之前,将上述成分分别高压灭菌并冷却至70℃以下,葡萄糖和硫胺素采用过滤除菌。平板储存于4℃。
封闭缓冲液:
0.1M NaHCO3(PH 8.6)
5mg/ml BSA
0.02% NaN3
过滤除菌,储存于4℃。
(8)TBS:
50mM Tris-HCl (PH 7.5)
150mM NaCl
高压灭菌,室温储存。
(9)PEG/NaCl:
20%(w/v)聚乙二醇-8000
2.5M NaCl
高压灭菌,室温储存。
(10)碘化物缓冲液:
10mM Tris-HCl (PH 8.0)
1mM EDTA
4M NaI
室温避光保存。
操作步骤:
第一天
以0.1M NaHCO3(PH 8.6)制备 100μg/ml的靶分子溶液。如果需要稳定靶分子,可以用含有金属离子的相似离子强度缓冲液。
在每孔内加入1.5ml 靶分子溶液,重复涡旋直至表面完全湿润(这一步要多注意,尽量避免溶液形成液珠)。
在湿盒中,4℃温和振荡孵育过夜。4℃保存于湿盒中备用。
第二天
(4)将ER2537(滴度测定时用来铺板的细菌培养物)接种至10ml LB培养基中。如果是在同一天扩增洗脱的噬菌体,也可以将ER2537过夜培养物接种于含有20ml LB培养基的250ml锥形瓶中(比例为1:100)。37℃剧烈振摇。
(5)将平皿反扣在洁净的纸巾上,去除包被液,加满封闭液,4℃孵育至少1h。
(6)去除包被液。用TBST(TBS+0.1%Tween-20)快速洗涤6次。反复旋转确保孔底及孔侧面都被洗涤。按照步骤5的方法去除洗涤液(也可利用自动洗板机洗涤)。洗涤要迅速,避免平皿干燥。(注意每次更换纸巾,以避免交叉污染)。
(7)用1ml TBST稀释4×1010噬菌体(10μl原库),加至包被后的平皿内,室温下轻缓摇动10-60min。
(8)以步骤5的方法去除未结合的噬菌体。
(9)以步骤6的方法用TBST洗涤板子10次,每次换用洁净的纸巾,避免交叉污染。
(10)用1ml的洗脱缓冲液洗脱结合的噬菌体。洗脱液可以是含有配体(0.1-1mM)的TBS,或是含有靶蛋白(100μg/ml)的TBS以和固化在平皿上的靶蛋白竞争结合噬菌体。室温下轻缓摇动10-60min。将洗脱液转入微量离心管中。
(10a)或使用通用缓冲液,0.2M甘氨酸-盐酸(PH2.2),1mg/ml BSA。轻缓摇动不超过10min,将洗脱液转入微量离心管中,以150μl 1M Tris-HCl(PH 9.1)中和。
(11)取小量洗脱液(1μl)测定滴度,如果有必要,可将第一轮或第二轮测定滴度的噬斑进行测序(见后续操作)。(未用的洗脱物可4℃保存过夜,第二天进行扩增。在这种情况下,用LB过夜培养ER2537,第二天,用LB培养基以1:100将该培养物稀释至20ml,加入未扩增的洗脱液,在250ml的锥形瓶内,37℃剧烈振摇孵育4.5h,进入步骤13)。
(12)将剩余的洗脱物进行扩增:将洗脱物加入20ml ER2537培养物中(对数早期),37℃剧烈振摇孵育4.5h。
(13)将培养物转入微量离心管中,4℃,10000转离心10min,将上清转入新的离心管中,再次离心。
(14)将80%的上清转入新的离心管中,加入1/6体积的PEG/ NaCl。4℃沉淀噬菌体至少60min或过
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