山西师大郜刚生物信息学-05-2-ncbi-cog.pptVIP

生物信息学课件郜刚EST对应基因产物的系统分析—COG分析 观点 祖先序列在漫长的进化过程中，可能产生直系同源和旁系同源两类蛋白质。 直系同源：简而言之，由不同物种的垂直家系进化而来的蛋白质，具有祖先蛋白质类似的功能 旁系同源：从相关物种基因组中复制的蛋白质，可能会产生新的功能 种系发生学中的同源（Homology） 传统的种系发生学是研究生物的形态结构为主的，所以认为如果两个或多个结构具有相同的祖先，则称它们同源（Homology）。 这里相同的祖先既可以指进化论意义上的祖先，即两个结构由一个共同的祖先进化而来（翅膀与手臂是同源的），强调了结构的相似性，不强调功能的相似性 也可以指发育意义上的祖先，即两个结构由胚胎时期的同一组织发育而来（乳房与睾丸同源）。 种系发生学，进化，强调结构的相似性，不强调功能的相似性 同源这一概念需与相似区分开来。 比如说，昆虫的翅膀、蝙蝠的翅膀和鸟类的翅膀是功能相似的，但却不同源，这种现象被称为非同源相似（或同形质，英文：Homoplasy）。这些相似的结构由不同的渠道演化而来，这种演化过程叫做趋同演化。 遗传学中的同源 在经典遗传学中，同源这一概念既不强调结构相似性，也不强调功能相似性，只是强调亲子关系的有无或者亲缘关系的远近。 比如同源染色体，异卵双生、同卵双生的双胞胎等。 只有当遗传学中涉及到DNA水平的序列时，才逐渐强调了DNA