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木聚糖酶特征序列与最适pH定量关系.PDF
28 3 ( ) Vol. 28 No . 3
2007 7 Journal of H uaqiao University ( Natural Science) Jul. 2007
: 1000 013( 2007)
pH
张光亚, 方柏山
( , 362021)
: G/ 11pH , ,
0. 97 , p 0. 000 1 , pH , , 2
pH 0. 6, 6 pH 0. 1,
. 91% , 0. 26 pH ,
. , 1YNA , 6 Pro, Leu,
Val, Val, Val Tyr, 3 7 , .
: ; pH; ; ;
: Q 814; Q 01; Q 39 : A
[ 1]
, .
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, ( Quantitative Structure
[ 2]
Activity Relationship, QSAR) . QSAR
[ 34 ]
, , ,
, , QSAR .
, ,
. , G/ 11
pH, , pH ,
[ ] , .
1
1. 1
G/ 11 Sw issProt Release 44. 4 PDB ( http:/ / www.
rcsb. org/ pdb/ ) , . 21 pH [ ] , 1F J
pH [ 6] . G/ 11 PS00776 PS00777 PROSIT E
( http:/ / us. expasy . org/ prosite/ ) , [ PSA] [ LQ]xEYY[ LIVM] ( 2)[ DE]x
[ FYWHN] [ LIVM F]x ( 2)E[ AG][ YWG][ QRFGS][ SG][ STAN]Gx[ SAF] . , [ ]
,x 20 . ,
[ 7]
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, ( K cat / K m 10 000 ) .
1. 2
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: ( 197 ) , , , , ; :
( 19 7) , , , , Email: bsfang@ hqu. edu. cn.
: ( 0 Q0018)
3 , : pH 293
[ 8]
1. 2. 1 Z Hellberg 29 , 3
, , , Z ,
[ 9]
. . 20 Z , 1.
1 20 Z
Tab. 1 Descriptor Z scales for amino acids
z 1 z 2 z 3 z 1 z 2 z 3
Ala (A) 0. 07 - 1. 73 0.09 Leu ( L) - 4. 19 - 1.03 - 0. 98
Arg ( R) 2. 88 2. 2 - 3.44 Lys ( K) 2. 84 1.41 - 3. 14
Asn ( N) 3. 22 1. 4 0. 84 Met ( M ) - 2. 49 - 0. 27 - 0.4 1
Asp ( D) 3. 6
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