ADF-MedeA-ME主要优势和最新文献.docVIP

ADF主要优势 Nobel Laureate Roald Hoffmann on ADF:What I really like about ADF is that the programs were clearly written by chemists for dealing with real chemical problems. A great suite of programs! ADF实现线性表度技术，计算速度快；计算速度几乎和计算的CPU数目呈线性关系。 ADF采用更接近实际情况的Slater基函数，计算结果更准确。 ADF中有独一无二的化学分析方法（包括键能分解、片段轨道和电荷降解）。 QM/MM方法可以处理几千原子的大体系，而MS是将二者分在不同模块中的，必须分别购买，而且不能QM与MM相结合来处理问题，因此在处理较大体系时计算量很大。 除了LDA和GGA之外，ADF还包括了非常先进的meta-GGA和杂化交换—相关函数（如B3LYP），其准确度远远超过了DMol3。在势能方面，其包含的杂化、SAOP、GRAC、LB94、post-SCF等也是MS所没有的。而MS中专门计算吸附的Sorption模块这个模块不是基于量子力学的，所以不具有这种功能。并且以上功能也只是在MS的CASTEP或者DMOL模块里才有，所以作一种吸附的研究需要MS的两个模块 ADF的BAND模块经常应用于非均相催化作用的研究。在研究某个化学吸附体系或一个化学反应时，提供势能面(PES)的计算。 MS中的量子力学模块Castep和Dmol3虽然也可以计算化学反应，但是在处理体系的时候，ADF对过渡态的寻找是使用Climbing NEB方法，而MS是使用NEB方法。Climbing NEB.这种方法比原来的NEB的计算量更小，计算速度更快，也更准确。包含了最高水平的相对论方法（ZORA和自旋轨道耦合），而MS没有，所以ADF适合重金属离子以及收敛。 ADF可以从建好的总体系上以用户制定的次级体系为主来分析其计算结果。程序会告诉你有意义的次级单元片段轨道（FO’s）是怎样与其它片段的轨道结合的，以至形成最终的分子轨道。并可通过ADFLevels可视模型分析执行这和第三一样是特定组才需要。 除了MS所具有的Mulliken电荷分析之外，ADF还能计算NBO原子电荷分析，没有Mulliken的缺陷。并可以衍出确切的双极矩和更多分子极矩的计算。 ADF提供Voronoy形变密度的电荷分析方法。 ADF可以计算得到Nalewajski键级，并且和实验反应的趋势以及化学直观上反应的情况有很好的吻合。 ADF中数据的表示（分子轨道系数、Mulliken布居），按照分子中化学片段的组成以及传统的元素基函数表示，提高了计算速度。 ADF使用独特的Te-Velde—Baerends数值积分方案。使得ADF使用相当少的点就可以直接做非常精确的积分。 提供了与其它程序的接口，大大提高了使用范围。 ADF中的QUILD模块：由局部描述的相连接的量子区域模块，允许同一系统中不同部分使用不同的计算模块，如不同的基组、XC功能和非DFT方法。这大大扩展了软件的使用范围。 能够提供源码。这意味着软件著作权的部分转移。这对于帮助用户通过修改源码进行编译，从而达到软硬件计算环境的最优化,提高计算效率，得到更加准确的结果非常重要。而且还可以使用户增加对程序算法的理解，使用户可以对软件进行二次开发，加入自己已有的程序模块，由此做出更具特色的创新性工作。 文献信息来自SCI数据库我们在ISI Web of Science检索引用了《Chemistry with ADF》[1]或《Precise density-functional method for periodic structures》[2]这两篇文章的文献，这两篇文章分别是ADF模块和BAND模块指定的引用文献。经过剔除冗余，我们一共得到442篇文献。下图显示了这些文献的发表数量随年份变化的关系，从图中可以看出，自2003年以来每年均有四、五十篇关于ADF的文章发表，而2007年则骤然增加到将近一百篇。经过多年来的发展与推广，ADF软件已经获得了大家的认可，逐渐成为化学工作者的常用研究工具，2006年JACS上甚至专门发表了一篇“Software Review”[3]，对ADF软件做了简要的介绍和评述。/lh/adf_ref.htm） 图2、ADF被引文献的簇类分析图 我们利用文献分析软件Omniviz对检索得到的结果进行簇类分析（图2），目前ADF软件的应用领域主要可分为如下几类： 纳米团簇 均相催化 表面与非均相催化 分子结构与晶体 波谱分析 金属配合物 稀土化合物 生物酶类化合物 化学反应机理 References