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计算机模拟研究荣筋拈痛方治疗骨关节炎的药效物质基础、作用靶点及作用特点
计算机模拟研究荣筋拈痛方治疗骨关节炎的药效物质基础、作用靶点及作用特点
郑春松 范展彪 叶蕻芝 付长龙 叶锦霞 吴广文 刘献祥
福建中医药大学 福建省中西医结合老年性疾病重点实验室
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摘????要:
目的:从分子水平探讨荣筋拈痛方治疗骨关节炎 (osteoarthritis, OA) 的药效物质基础、作用靶点及作用特点。方法:通过检索北京大学中草药有效成分三维结构数据库、中药原植物化学成分手册和相关文献, 共检索出荣筋拈痛方中有效化合物411个, 在Discovery studio模拟平台上建立荣筋拈痛方化合物分子数据集。通过检索TTD数据库和相关文献, 确定基质金属蛋白酶 (matrix metalloproteinase, MMP) -1、MMP-3、诱导型一氧化氮合酶 (inducible nitric oxide synthase, i NOS) 、5脂加氧酶 (5 lipoxygenase, 5-LOX) 、转化生长因子β1 (transforming growth factor-β1, TGF-β1) 、白细胞介素1β (interleukin 1β, IL-1β) 和肿瘤坏死因子α (tumor necrosis factor-α, TNF-α) 为荣筋拈痛方治疗OA的靶点, 从RCSB蛋白数据库下载其蛋白质晶体结构, 在Discovery studio模拟平台上建立其蛋白分子数据集。通过分子对接和生物网络技术, 构建荣筋拈痛方化合物-OA靶点作用网络, 研究荣筋拈痛方治疗OA的药效物质基础、作用靶点及作用特点。结果:建立的荣筋拈痛方化合物-OA靶点作用网络中共有159个节点, 包括7个OA靶蛋白节点和152个荣筋拈痛方化合物节点;7个OA靶蛋白节点中, MMP-1节点可以与90个化合物节点连接、MMP-3节点可以与18个化合物节点连接、i NOS节点可以与43个化合物节点连接、5-LOX节点可以与16个化合物节点连接、TGF-β1节点可以与40个化合物节点连接、IL-1β节点可以与109个化合物节点连接、TNF-α节点可以与53个化合物节点连接;152个荣筋拈痛方化合物节点中, 约76.16%的化合物的作用靶点数量≤3个、11.26%的化合物的作用靶点数量≥5个。荣筋拈痛方的活性成分主要为苷类和黄酮类。荣筋拈痛方化合物-OA靶点的作用关系曲线遵循幂函数p (k) =k-1.79411规律。结论:荣筋拈痛方治疗OA的药效物质基础为苷类和黄酮类, 主要作用靶点为IL-1β、TNF-α和MMP-1, 在缓解疼痛及延缓软骨退变方面具有广谱的作用特点。
关键词:
骨关节炎; 荣筋拈痛方; 计算机模拟;
作者简介:刘献祥 E-mail:liuxianxiang@163.com
收稿日期:2017-09-11
基金:福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划资助项目 (闽教科[2017]52号)
A computer simulation study on pharmacodynamic material basis, action targets and characteristics of Rongjin Niantong Fang ( 荣筋拈痛方) in treatment of osteoarthritis
ZHENG Chunsong FAN Zhanbiao YE Hongzhi FU Changlong YE Jinxia WU Guangwen LIU Xianxiang
Fujian University of Traditional Chinese Medicine; Fujian Key Laboratory of Integrated Medicine on Geriatrics;
Abstract:
Objective: To explore the pharmacodynamic material basis, action targets and characteristics of Rongjin Niantong Fang ( 荣筋拈痛方, RJNTF) in the treatment of osteoarthritis ( OA) at molecular level. Methods: Four hundred and eleven effective chemical compounds were searched out from RJNTF by searching Peking University database
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