大连市肠道病毒71型基因特征.pdfVIP

·1046 · 中国热带医学 2012 年第12卷第9 期 China Tropical Medicine，September 2012 ，Vol. 12，No.9 ·论 著· 大连市肠道病毒71 型基因特征分析 栾明春，吕秋月，孙楠，薄志坚，刘丹红* 摘要：目的 了解大连市手足口病病原体肠道病毒71 型（EV71) 的VP 1 区段的基因特征。方法 用RT-PCR 方法 从手足口病患者临床标本中扩增EV71 的VP 1基因全序列, 利用软件进行同源性分析和构建系统发生树。结果 测序 获得的9 株病毒基因与C4 亚型代表株具有较高的核苷酸和氨基酸序列同源性。在系统进化树上, 9 株病毒基因与C4 基因亚型代表株处于同一分支。结论 大连市EV71 病毒株属C4 亚型。 关键词：肠道病毒EV71 型；手足口病；基因型 中图分类号：R512.5 文献标识码：A 文章编号：1009-9727(2012)9-1046-03 Genetic characterization of Enterovirus 71 in DaLian City.LUAN Ming-chun,LV Qiu-yue,SUN Nan,BO Zhi-jian, LIU Dan-hong. （DalianCenterforDiseaseControlandPrevention,Dalian116021,China） Abstract:Objective To explore the molecular characteristics of the VP 1 coding fragment of enterovirus 71( EV71) strains isolated from Dalian.Method The complete VP 1 coding gene of EV71 strains amplified by RT-PCR from clinical specimens of children with hand-foot-and-mouth disease （HFMD）in Dalian were sequenced and analyzed by software. Result The analysis indicated that the nucleotide and amino acid homogeneity of 9 strains were higher with C4 representative isolate and clustered with reference strains of C4 subgenotype in the phylogenetic tree.Conlusion The EV71 isolated strains caused HFMD in Dalian belonged to subgenotype C4. Key words:Enterovirus 71; Hand- Foot- Mouth Disease; Genotype 近年来，由EV71 引起的手足口病在亚洲地区的 产物大小为1 015bp ，PT-PCR 操作按说明书进行，反 [1] 流行呈上升趋势 。2008 年卫生部将手足口病列入 应条件为50℃30 min、94℃2 min、94℃30s、51℃30s、 传染病防治法规定的丙类传染病。VP 1 蛋白是EV71 68℃1.5 min, 经35 个循环, 68℃10 min, 转入4℃。 病毒中和决定因子，它直接决定病毒的抗原性，VP 1