ＥＲＩＣ－ＰＣＲ：一种快速鉴别环境细菌菌株的方法.pdfVIP

应用与环境生物学报 1999,5(Suppl):30一33 f9iia.J.Am (.Ewvi- Biol. 1999-10-05 ERIC-PCR:一种快速鉴别环境 细菌菌株的方法 赵立平 肖虹 李艳琴 张 峰 (山西大学生物技术研究所 太原 030006 摘 要 以ERIC(肠杆菌基因间共有重多序列)序列设计的特异引物对3株大肠杆菌,3抹软腐欧氏杆茵,2株 草生欧氏杆菌、1株梨火应欧氏杆菌、1株催挽克氏菌,1株朗沟肠杆蔺和9株具有阵盼能力的细苗等加种细蔺 的基因组DNA进行PCR分析.每种菌株均存在数目不等的各自独特的带型，能够区分同一种类中极为相近的曲 株.经多次重复，各特异性扩增的主要带塑能重复毯定出现.双类分析的结果表明 供试菌株多致按照分类地位 归到相应的组中，种具有降助能力的细苗中.2种分离自处理舍化废水池活性污泥,7种来自土城样品.ERIC. PCR指纹图显示，前2种属于一类，都有一条大小约1.1kb的主带，其它，种土魏中分离出来的细菌除其中1种 有l条约1.2kb大小的主带外，其余6种都有1条大小约1.4kb的带 胶类分析将从土搜中分离出来的纽亩归 为3种不同的类型.ERIC-PCR可以从分子水平对细菌基因组进行快速指纹图分析 在对环境细曲分离物进行快 速鉴定和归类等方面具有实用价值. 关.饲 ERIC.PCR;细自;DNA指纹图 中日法分奥号 0939.110.9:078 ERIC-PCRASANEW TOOLFORQUICKIDENTIFICATION OFENVIRONME NTALBACTERIA ZHAOUping,XIAOHong,LIYangin9HANGFeng (Biotechnolney栩二 ，ShaaxiUnianky,Teiyuan030006) AbstractERIC(Enterobacteria.lRepetitiveIntergenicConsensus)sequenceisakindofdispersedrepetitive DNAsequencefoundinthegenomeofeubacteria.GenondcDNAof20differentbacterialstrainsincluding3 Eicherichmcolt,3Erwiniacnrotooura,2￡.herb ,1E.amyboora,1Kkbaoxytoca,IEnterobacter cloocaeand9phenoldegradingbacteriawereamplifiedandanalyzed勿PCRwithprimersspecificforERICse- quence.EachstrainshoweddifferentproflieofbandpatternswhenPCRproductswereanalyzedinagerosegel electrophoresis.Thestrainsofthesamespecieswereresolvedbyuniquebendsspecificforeachstrain.Distine- fivebandpatternsofthestrainswererepeatableamongdifferentbatchesofexperiments.Twoofthe9phenolde- gradingbacteriawereisolatedfromactivatedsludgefortreatingthewastewaterfactcokeindustry,whiletherest rfomsoilsamples.The2strainsfromacokeplantshowedonemajorbandof1.1kbinERIC-PCR.Oneofthe 7soilstrainshadone1.2khbandandtheother6soilstra