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军事医学科学院考博微生物02、04、05年考题
军事医学科学院(博士)微生物
2002年微生物1、毒力岛:毒力岛具有以下特点:1. 编码细菌毒力基因簇的一个相对分子质量较大的(20~100kb左右)染色体DNA片段;2.一些毒力岛的两侧具有重复序列和插入元件, 但是也可以没有;3.毒力岛往往位于细菌染色体的tRNA基因位点内或附近, 或者位于与噬菌体整合有关的位点,肠致病性大肠杆菌(EPEC)的LEE毒力岛就位于tRNA selC位点;4.毒力岛DNA片段的G+C mol % 、密码使用和宿主细菌染色体有明显差异, 有的比宿主细胞的G+C mol% 明显高, 有的 明显低; 5.毒力岛编码的基因产物许多是分泌性蛋白和细胞表面蛋白, 如溶血素、菌毛和血红素结合因子, 一些毒力岛编码细菌的分泌系统(如Ⅲ型分泌系统)、信息传导系统和调节系统; 6. 一种病原菌可以有一个或几个毒力岛; 7. 一部分学者认为, 细菌的毒力岛应该包括位于噬菌体和质粒上的、与细菌的毒力有关的、其G+C百分比和密码使用与宿主细胞明显不同的DNA片段;8.毒力岛可能与新发现的病原性细菌有关。
2、定点诱变技术:是在体外特异性地取代、插入或缺失DNA序列中任何一个特定碱基的技术,包括盒式取代诱变、寡核苷酸引物诱变及PCR定点诱变等。3、DNA微点阵芯片:寡核苷酸芯片的主要原理与cDNA芯片类似,主要通过碱基互补配对原则进行杂交,来检测对应片段是否存在、存在量的多少。它与cDNA芯片的本质差别在于寡聚核苷酸芯片固定的探针为特定的DNA寡聚核苷酸片段(探针),而后者为cDNA。基因表达芯片的两个重要参数是检测的灵敏度和特异性。cDNA芯片由于基因长短不同以至Tm值各异,众多的基因在同一张芯片上杂交,使得杂交条件很难同一,使得传统的cDNA芯片的分辨能力受到限制。寡聚核苷酸芯片序列选择经过优化,利用合成的一定长度(如20,30,70-mer等)的寡核苷酸单链探针代替全长cDNA点样,制成芯片。其优点:无需扩增,防止扩增失败影响实验;减少非特异杂交,能有效区分有同源序列的基因;杂交温度均一,提高杂交效率;减少二级结构。此外,寡核苷酸芯片还可以通过原位合成法制备,而cDNA芯片只能通过后者制备。上述特点使得寡核苷酸芯片的应用日益广泛。但是当寡核苷酸序列较短时,单一的序列不足以代表整个基因,需要用多段序列。
高密度的寡核苷酸芯片作为一个有力的工具广泛用于分析基因组数据,与传统的凝胶分析方法比较起来,具有成本低、高通量、高度自动化的优点,这些寡核苷酸芯片,已广泛用于用遗传变异扫描、分子条编码、基因表达检测及测序。寡核苷酸芯片主要用途包括:
1)临床诊断方面。用于研究人类多基因相关性疾病(如癌症、心血管疾病等),发现相关的基因及其相互作用机理,寻找早期发现,早期诊断的方法;同时还可制成外源性病原体相关基因芯片,如病毒性肝炎芯片等;
2)基因功能研究。应用基因芯片可以开展DNA测序、基因表达检测、基因突变性、基因功能研究、寻找新基因、单核苷酸多态性(SNP)测定等研究;
3)药物筛选和新药开发。采用了基因芯片技术来寻找药物靶标,查检药物的毒性或副作用,用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验,缩短药物筛选所用时间,在基因组药学(pharmacogenomics)领域带动新药的研究和开发;并可指导实现合理用药。
4)环境监测和指导高科技农业等。监测流行病和传染病扩散;监测有害微生物的发生和传播;农、林、牧、渔等产业的品种改良和病虫防治。
5)其它。如DNA身份认定等。4、细菌基因组学概念,意义。见下.5、慢性乙型肝炎致病机理?乙型肝炎病毒 (HBV) 属嗜肝DNA 病毒科 (hepadnaviridae),基因组长约3.2kb ,为部分双链环状DNA。HBV只有3200bp,是一个相当小的病毒。其基因组共有四个ORF,编码以下一些蛋白:Core蛋白和pre-core蛋白,Pol蛋白,X蛋白,以及S蛋白(L,M,S)。Core是核衣壳蛋白;Pre-core现在不知道有何功能,它对病毒的复制不是必要的,但是可能与抑制宿主的免疫反应有关;X蛋白对病毒复制是重要的,还与肝癌的发生有关;S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关。
HBV的致病机理尚未完全明了。鉴于乙肝临床类型可表现为多种多样(如急性肝炎、慢性活动性肝炎、慢性迁延性肝炎、重症肝炎及HBsAg无症状携带者),因而认为HBV的致病作用一般病毒不同。可能不是由于病毒在夺细胞内增殖而直接损害靶细胞,而很可能系通过机体对病毒的免疫反应而引起病变和症状。1 特异性抗体:受乙肝病毒感染后,机体可产生三种抗体,抗HBs、抗HBc 及抗HBe。但抗HBs仅能作用于细胞外的HBV,在预防感染上较重要,而在疾病恢复时尚需细
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