长链非编码RNA 的功能及其研究.pdfVIP

中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2010, 32(3): 350−356 特约综述 特约综述 长链非编码RNA 的功能及其研究 余良河　李　楠　程树群* (第二军医大学东方肝胆外科医院, 上海 200438) 摘要　　长链非编码RNA (Long noncoding RNAs, lncRNAs)是一类无或少有蛋白编码能力的 复杂长链非编码RNA, 在大部分真核生物基因组被转录。目前大多数lncRNAs 已分类, 但其功能 有待深入研究。已有研究表明lncRNAs 在调节生长发育、细胞定向分化、亚细胞结构分布、进化 选择和人类疾病的关系等方面有重要作用。本文就对lncRNAs 的功能及其在医学方面的研究进展 作一综述。 关键词　　长链非编码RNA; 转录; LncRNAs; 长链非编码RNA(Long noncoding RNs, LncRNAs) RNA链是由X基因的重复A 区转录的, 对哺乳动物早 首先是在大鼠全长cDNA 序列文库中被描述的。最 期X- 染色体非活化起着关键作用。TrxG 蛋白和激 初分离出长链非编码RNA接近蛋白编码基因的非编 动型PcG蛋白相互作用维持转录的状态, 可能是通过 码RNA, 包括重叠、顺反义、双向或内含子非编码 lncRNAs 使二者的靶点接近[9] 。源自Hox 基因的特定 RNA 。LncRNAs 不单独表现任何已知RNA 的特性, 非编码RNA在体内直接与组蛋白甲基转移酶Ash1 结 而是表现出这些特性的综合作用( 图1)。LncRNAs 合, 其目的是使TrxG 蛋白特异结合染色质[10] 。虽然 异常丰富, 最初被认为是由于转录过程中RNA 聚合 没有报道发现lncRNAs的特异性表达和转录激活间的 酶的低保真度所致[1] 。但是有些lncRNAs 的表达仅 伴随作用, 但也有文献报道非编码RNA的转录可能抑 [2] 制相邻Hox 基因的表达[10,11] 限于特定的生长发育阶段 , 如大鼠lncRNAs 在胚胎 。虽然尚有争议, 但已证 干细胞分化过程中[3], 以及在大脑中多表现出精确的 实特定非编码RNA 通过结合PcG 和TrxG 蛋白靶点, 亚细胞分布[4] 。不同于小分子RNA 或蛋白质, 目前 对维持基因表达的活性或非活性状态起关键作用。 尚无法根据非编码RNA 序列或结构推断其功能。本 现已证实包括Airn 和Kcnqlot1 在内的大量 文就对lncRNAs 的功能及其在医学方面的研究进展 lncRNAs 表达印记基因位点在等位基因的表达过程 [12,13] 作一综述。 中起关键作用 , 最新研究证实单簇的印记基因能 通过不同机制沉默。大鼠胎盘中, 以顺式方式沉默 1 LncRNAs对转录的影响 亲链特定含有S1c22a3、S1c22a2 和Igf2r 基因[14]在 LncRNAs 可以通过许多机制调节RNA聚合酶II 内长400 kb 的一区域, 需要不到108kb的非编码RNA 的活性, 包括通过干扰起始复合物的形成, 影响启动 链Airn 。类似于Xist, Airn 停留在细胞核内[15], 并表 子的选择性。在人DHFR 位点上, 一条长链非编码 达在子代染色体的印记基因外侧[16] 。Airn 并非是一 链起源于主要DHFR启动子上游区, 可以抑制下游蛋 成不变的分布在印记结构域, 而是首先聚集在Slc22a3 [5] 启动子, 然后与组蛋白H3- 赖氨酸-9- 甲基- 转移酶 白编码基因表达 。PcG