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基于奇异值求通解方法进行基因调控网络构建.pdf
第43卷第4期 中南大学学报(自然科学版) 、,oL43NO.4
2012年4月 JournalofCentralSouth and Apr.2012
University(ScienceTechnology)
基于奇异值求通解方法进行基因调控网络构建
沈威1一,郑明1,刘桂霞1,邢舯1,吴佳楠1,周春光1,周柚1
(1.吉林大学计算机科学与技术学院,吉林长春,130012;
2.北华大学计算机科学技术学院,吉林长春,132021)
摘要:在改进分解权值矩阵的微分方程模型基础上,引入奇异值分解方法来辅助运算。该算法不是通过奇异值分
解的特解得到网络的最终结果,而是通过所算得的通解提供候选解集的方法。为微分方程模型算法缩短运算时间
和提高结果精度。将本文算法与其他传统微分方程模型算法进行对比,验证结果表明:该算法的效率较高.
关键词:奇异值分解:微分方程模型;基因调控网络:候选解集;通解:无标度网络;数学建模
中图分类号:TPl8 文献标志码:A 文章编号:1672-7207(2012)04-1377-05
Constructionof networkbasedon
generegulatory
for set
value solution
singulardecomposition
SHEN Youl
Weil一。ZHENG Gui.xial,XINGChon91,wUJJa-n自Inl,ZHOUChun—guan91,ZHOU
Mm91,LIU
Scienceand 130012,China;
(I.CollegeofComputerTechnology,JilinUniversity,Changchun
Scienceand
2.couege Technology,BeihuaUniversity,Jflin132021,China)
ofComputer
onthe
Abstract:Thevalue methodwa$introducedtocalculatethenetworkbased
singulardecomposition improved
valuedifferential fromthe value
singulardecomposition
decomposedweighted equationmodel.Differentlyexisting
used methodwas the set.The
modelfor final value usedto solution
gettingnetwork,thesing
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