OPRM1基因PCR产物和测序产物三种纯化方法的比较.pdfVIP

OPRM1基因PCR产物和测序产物三种纯化方法的比较.pdf

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12O 现代检验医学杂志 第 27卷 第 1期 2012年 1月 JModLabMed,Vo1.27,No.1,Janua.2012 OPRM1基因PCR产物和测序产物三种纯化方法的比较 李少英 ,马晓燕,张双全,张慧敏 ,黎 青 (广州医学院第三附属医院妇产科 ,广州 510150) 摘 要 :目的 探讨一种快速 、简便、效果好的OPRM1基因PCR产物和测序产物纯化方法 ,建立稳定的DNA测序技术平 台。方法 采用 乙醇 /醋酸钠 、过柱和 SAP-Exonuclease1结合BigDyeXterminatorPurificationKit3种纯化方法,对 5O份 OPRM1基 因PCR产物和测序产物进行纯化效果的比较 。结果 SAP—ExonucleaseI法对 PCR反应产物进行纯化 的回收 率显著高于 乙醇 /醋酸钠和过柱法 ,分别为 0.86土0.01,0.48土0.08,0.65-4-0.01(t一32.5,P 0.001;t一86.1,P 0.001);BigDyeXterminatorPurificationKit法对测序产物进行纯化成功率显著高于 乙醇/醋酸钠和过柱法 ,分别为 100 , 62 和 84 (x。一23.46,P 0.001; 一8.70,P一0.003)。结论 SAP-ExonucleaseI结合 BigDyeXterminatorPurifica— tionKit是一种快速 、简便、效果好 的测序纯化方法 。 关键词 :脱氧测序法;虾碱性磷酸酶 ;核酸外切酶I;阿片受体基因 中图分类号:Q503 文献标志码:A 文章编号 :1671—7414(2O12)O1—12O一03 doi:1O.3969/j.issn.1671-7414.2012.01.039 ComparingAnalysisofThreeDifferentPurificationM ethods forPCR andSequencingPruductsinOPRM 1GeneSequencing LIShao—ying,MA Xiao—yen,ZHANG Shuang—quan,ZHANG Hui—min,LIQing (DepartmentofObstetricsandGynecology,theThirdAffiliatedHospital, GuangzhouMedicalCollege,Guangzho“510150,China) Abstract:Objective Lookingforaquick,simpleandeffectivepurificationmethodforPCRandsequencingproducttoestab— lishstableDNA sequencingtechnologyplatform.Methods 50PCR productsandsequencingproductsofOPRM 1genewere purifiedbyethanl/sodium acetate,spin—columnandSAP-ExonucleaseIcombinedwithBigDyeXterminatorPurificationKit. Results TherecoveryrateofPCR productsthatwaspurifiedbySAP-ExonucleaseImethodswassignificantlyhigherthan byethanl/sodium acetateandspin-columnmethods.Theirrecoveryrateswere0.86土0.01,0.48士0.08,0.65士0.01(£= 32.5,P0.001;£一86.1,P0.001).AndthesuccessratesofsequencingproductsthatwaspurifiedbyBigDyeXterminator PurificationKitwassignificantlyhigherthanbyethanl/sodium acetateandspin-column.Theirsuccessrateswere100 , 62 and84 (x。:23.46,P 0.001; =8.70,P=0.003).Conclusion ThemethodofSA

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