翘嘴鳜淀粉酶基因SNPs和微卫星位点多态性的检测研究.pdfVIP

第34卷 第 1期 暨南大学学报(自然科学版) Vo1．34 NO．1 2013年2月 JournalofJinanUniversity(NaturalScience) Feb． 2013 翘嘴鳜淀粉酶基因SNPs和微卫星位点多态性的检测 彭敏燕， 梁旭方， 方 荣， 于海静， 朱 滔 (暨南大学 生命科学技术学院 生物工程学系，广东 广州 510632) [摘 要] 本研究主要检测翘嘴鳜淀粉酶 (amylase，AMY)基因的单核苷酸多态性 (singlenueleotidepolymorphisms， SNP)和微卫星位点多态性．实验采用 PCR产物直接测序法(PCR—directsequencing，PCR—DS)检测翘嘴鳜AMY基因 组序列的SNPs和微卫星位点，并使用创造限制酶切位点PCR法(createdrestrictionsitesPCR，CRS—PCR)和PCR—DS 法对SNPs进行分型，应用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测AMY基因微卫星位点的多态性．实验结果发现AMY基因第 l 内含子有一个SNP位点A1，第5内含子有3个 SNPs位点(A2、A3和A4)；此外，第5内含子中还存在一个微卫星 位点Bl，共检测到4个等位基因，有9种单倍型．在翘嘴鳜群体中，4个SNP位点呈中度遗传多样性 ，而微卫星位点 表现出高度遗传多样性． [关键词] 淀粉酶； 翘嘴鳜 ； 单核苷酸多态性 ； 微卫星 [中图分类号] Q786 [文献标志码] A [文章编号] 11300—9965(2013)01—0096—05 DetectionofSNPsandSSRofamylase(AMY)geneinSinipercachuatsi PENGMinyan， LIANGXufang， FANGRong， YUHaijing， ZHUTao (DepartmentofBioengineering，CollegeofLifeScienceandTechnology，JinanUniversity，Guangzhou510632，China) [Abstract] Theaimofourresearchistodetectthesinglenucleotidepolymorphism (SNP)andsimple sequencerepeats(SSR)ofamylasegeneinSinipercachuatsi．PCR—directsequencing(PCR—DS)method wasusedtolocatetheSNPsandSSRs．thenSNPsgenotypingwascarriedoutwithcreatedrestrictionsites PCR(CRS-PCR)andPCR—DSmethod，andpolyacrylamidegelelectrophoresiswasusedtocheckthe polymorphism ofSSR．TheresultsindicatedthatthereareoneSNPlocusA1inintronl0fAMYgeneand threeSNPs(A2，A3andA4)inintron5．Inaddition，flSSRlocusB1locatinginintron5shows4al— lelesand9haplotypesintota1． [Keywords] amylase； Sinipercachuatsi； singlenucleotidepolymorphism； simplesequencere— peats 翘嘴鳜(Sinipercachuatsi)隶属于鲈形 目(Perci— 殖的鳜鱼主要是翘嘴鳜和大眼鳜，翘嘴鳜养殖规模 formes)、暖鲈科 (Percichthyidae)、鳜属，俗称桂鱼、 不断扩大，已经成为我国重要的名贵经济鱼类，因而 桂花鱼、胖鳜、季花鱼等，是淡水底栖的肉食性鱼类． 具有很大商业养殖价值 】．淀粉酶 (amylase，AMY) 它具有体型大，生长快，味道鲜美等特点，深受国内 是一种消化酶，主要分布在