五种农业害虫微小RNA基因的生物信息学预测与分析.pdfVIP

ANDANALYSISAMasterMICRORNADissertationBIoINFoRMATICFIVEForProf．LiFeiPlantProtectionPESTSPartialFulfillmentGENESOFofofSSubmittedS2ofof2012tociencethetheINInIDENTIFICATIoN ～ ABSTRACT……………………………………………………………………………………………………………………………IIIRNA…………………………………………………………………………………………………………………．14．14．257．4 l11 waswerewerewerewerewereABSTRACTABSTRACTmiRNAmolecularmicroRNAmostmicroRNAsmiRNAmethodsmachinemethods．ThemicroRNAsmicroRNAmicroRNAmicroRNAmirandaANDANALYSISmiRNAsmiRBasemiRNASMICRoRNAbecaussebeenunderstood．InusedhashashomoloiesToKEYareanaaaaaRNAsRNA．InrolesresearchnewRNARNAresearchRNARNARNAsreference．AsreferenceRNABIoINFoRMArICFIVEoneoccurrencePESTSatGENESSmallassociatedandand88and972R1eraofofofofofofofotherofofastotofivefromforandandandandclassclassdifferentiationdiscoverdatabase．52detected3UTRdataformationencodethethethetask．ThetraditionaltoolthisthethethetheSthe0Fcancersmallstillsmallsmallstriatellus．Asoftwaresmalllifelesslaborious．Thelevel．Ininisinvolvedininsectisisinidentifedidentified1INIDENTIFICArIoN VmiRNAmicroRNAreversePCRuntranslateunitntRNARNA．inducedIIIProtein1ICDSmicroRNA PalakodetiRNAZamoreandetetetetetandandSiomi201 miRBase462nuclearnucleolarZamoreanda1．201201etetetetetandAnsel mRNABlota1．1a1．a1．etetetetet 4anda1．201etetetetetet Zamorea1．a1．20a1．20etetetetetetetand11 MatureMamiRNAmiRNAFeifein6aRNA6of 第一章文献综述 andFukushima 码蛋白质的短序列RNA，不编码蛋白质，广泛存在于真核生物qb(Hohjoh 有长达28nt的microRNA，其前体一般在60～1 lOm的长度范围(Barrel2004)；3)在基 et 因组的分布一般成簇(cluster)的存在于基因组的内含子、外显子(Kima1．2006)或调控 eta1．201 序列qj(Au 使它与大多数寡核苷酸和功能RNA的降解片段区别开来；5)前体序列为发卡结构， et 以及loop环结构(Friedlander et 结合的种子序列，物种间高度保守(Brennecke a1．2005)，这一认识现在受到大量数 据的挑战，但是学界还没有一个统一的观点，因此，在大量研究中，仍然考虑microRNA 种子序列的存在(俞焙秦，刘炳亚