猪育种新技术-中国种猪信息网.PPT

第二点则是找准测定部位，获取清晰影像. 按照我国标准和遗传评估方案的要求，测定部位为猪左侧倒数第 3~4 肋骨之间距背中线 5 cm 处，最好的方法是使用超声波仪的探头由背腰结合处向头部缓慢推进找出倒数第 3~4 肋骨（图 1，2），图 2 所示的从右向左的方向依次为倒数第 1、2、3、4 肋骨。 其操作要点为参数设置合适、探头耦合密实（涂抹超声胶或植物油），按压力度适中，探头方向垂直于皮肤，平行于背中线，保持 5 cm 的距离，对 B 超参数的设置也十分重要，同时做到以上几点才能有效获取较为清晰的超声影像。 猪育种新技术 曹洪战 河北农业大学 教授、博导 QQ：976450249 有关猪的育种 常规育种，重在落实、持之以恒 常规的育种方法主要利用表型值和系谱信息进行BLUP预测估计育种值，在猪的遗传改良方面取得了很大进展 育种新技术，迎头赶上、奋起直追 国家提倡，大众创新、万众创业，“新”是其核心内容，育种本身就是创新，育种新技术是新上加新 育种新技术是抄近道追赶 育种新技术 全基因组选择 育种目标的变化 测定技术的变化 全基因组选择 什么叫全基因组选择 为了进一步提高育种的效率，T.H,Meuwissen等提 出 了 一 种新的标记辅助选择方法，即全基因组选择（Genomic selection,GS）。该方法假设覆盖全基因组上的高密度SNPs标记中至少有１个SNP与 QTL处于连锁不平衡关系，利用SNP估计每个QTL的效应，从而获得个 体 的 全 基 因 组 估 计 育 种 值 （Genomic estimated breeding value, GEBV）。 它与标记辅助选择的区别 随着分子遗传学技术的发展，已经发现了大量与猪经济性状相关联的基因或分子标记,例如,雌激素受体（ESR）基因、胰岛素样生 长 因 子 ２（IGF2）基因和兰尼定１型受体（RYR1）基因等。 标记辅助选择（MAS）方法可以准确、快速地对目的性状进行选择，在猪育种中得到了广泛应用，但是其估计位点效应范围有限且取得的遗传进展较小。 全基因组选择的优点 不仅可以提高选择的准确性，尤其是一些低遗传力性状、难以测量的性状、限性性状、生长后期测定的性状、屠宰性状和免疫力等，还可以在动物出生时或者胚胎期即可预测 GEBV，从而缩短世代间隔，大大提高遗传进展。 全基因组选择商业化应用 在猪的全基因组测序完成后，A.M.Ramos等对商业品种杜洛克（34头）、皮特兰（23头）、长白猪（29头）、大白猪（36头）和野猪（36头）共5个品种的DNA分别混池，采用全基因组重测序方法鉴定出数十万个SNPs，并从中选择设计出PorcineSNP60 Beadchip。该SNP芯片共有64232个SNPs，检出率可达97.5%，SNP信息可靠。 随着猪60kSNP芯片的商业化和测序的成本不断降低，全基因组选择方法成为在猪育种领域的新热点，并已经从试验阶段逐步走向应用阶段，成为未来长期最大化提高遗传进展的育种新技术，将对中国猪种遗传改良发挥巨大的推动作用。 全基因组选择的过程 实施全基因组选择需要具备一定数量、并记录相关性状的参考群体和适宜标记密度的SNP芯片，构建表型值与标记信息的预测方程，最终利用预测方程计算候选个体标记信息的GEBV，而候选个体无需 其 表 型 记 录，通 常 在 其 出 生 后 便 可 以 预 测GEBV， 计算GEBV的过程大致分为以下步骤： （1）利用SNP标记推导出每个个体在每个QTL上的基因型， （2）估计每个QTL基因型在性状上的效应， （3）所有QTL效应值的总和便是候选个体的GEBV HYBOR 公司，保育猪进入测定舍时戴上专用耳标，采集其耳组织，然后提取 DNA，每头测定几万个 SNP，由电脑进行系统分析，然后采用基因组育种值 BLUP 综合指数（GBLUP）作为辅助选择的依据 有效群体规模 A.M.Haberland等建议对猪进行全基因组选择时，参考群体至少要达到1000头，每个家系建议测定40-50头。 有效群体的大小会直接影响全基因组育种值的准确性 全基因组选择的应用研究 猪60kSNP芯片商业化后，使得全基因组选择在猪育种中的研究和应用具有可实施性和操作性。大量研究表明，利用该SNP芯片得到的GEBV具有较 高 的 准 确 性。 在肉质方面E.Gjerlaug-Enger等利用猪60kSNP芯片对长白和杜洛克猪的肌间脂肪进行全基因组选择，GEBV的准确性（0.63）明显比传统选育方法（0.36）高。 全基因组选择的实际应用 近年来，全基因组选择已经成为猪育种界的热点，全球各个知名猪育种公司已经将该技术作为新的育种手段实施应用，并且少数大型猪育种公司对猪的大量性状和品系都实施了全基因组选择。 PIC作为全球最大的种猪改良公司，