甘露糖二糖在气相中的结构和光谱分析研究.pdfVIP

甘露糖二糖在气相中的结构和光谱研究 摘 要 糖蛋白是人体中一种重要的蛋白质，它由多糖和蛋白质组成的。糖蛋白在结 构、含量、配比及分布上的改变使人体产生了很多疾病，比如关节炎、肿瘤、肝 病等，对糖蛋白中多糖和蛋白质之间的相互作用进行研究是十分有意义的。在所 有的N 型糖蛋白中，多糖和蛋白质发生相互作用都是通过一种中心五糖作为连接 桥梁的。研究多糖和蛋白质的相互作用，需要对这个中心五糖的结构进行深入的 研究。 本论文使用蒙特卡罗和量子化学方法，对三种不同连接方式的甘露糖二糖分 子构象进行了全空间搜索和结构优化，得到了三种甘露糖二糖分子势能面上所有 的局域最小构象，为中心五糖结构的研究奠定了基础。 本论文分为四个章节： 第一章：本论文的研究背景介绍，通过糖蛋白和中心五糖的相关知识介绍引 入本文的研究对象甘露糖二糖。 第二章：介绍了在计算中所有用到的基础理论，包括分子力学方法、蒙特卡 罗方法、量子化学方法和基组的相关知识。 第三章：首先介绍了甘露糖和氢键的基本知识，然后是构象搜索和结构优化 的详细计算过程，最后是甘露糖二糖的势能面和频率分析。通过计算，得到了甘 露糖二糖的一系列稳定构象，并分析了稳定构象是因为分子内氢键和环间氢键的 作用。同时对最稳定的几个构象进行了振动光谱计算，为以后的实验工作提供理 论上的指导。 第四章：本文所做的工作总结及创新之处。 关键词：蒙特卡罗 甘露糖 糖蛋白 I 甘露糖二糖在气相中的结构和光谱研究 Abstract Glycoprotein is an important protein in human body which is consist of glycan and protein. The change of its configuration, content or distribution may cause many illness, such as arthritis and knub. It is meaningful to study the interaction between glycan and protein. In particular, all of the N- glycoproteins have a pentasaccharide as the bridge of glycan and protein. It is necessary to study the configuration of pentasaccharide for understanding the interaction principle of glycan and prtein. Structural motifs and spectral signatures of three different types of dimannosides were studied in the gas phase with Monte-Carlo method based on molecular mechanics and quantum chemistry method in this thesis. The lowest-lying conformers were found, which is the base of building the structure of pentasacchride. There are 4 chapters in this thesis. 1. The background of our research was introduced. The importance of glycoprotein in human body and the reason why we have interest in the dimannosides were introduced.