第二章 生物芯片的分类.ppt

第二章 生物芯片的分类;根据不同的分类标准， 生物芯片可以分为不同的种类。;生物芯片的分类（1） ;DNA芯片技术的比较 (Comparison of DNA Chip Technologies);寡核苷酸芯片（Oligo-Chip）;cDNA芯片（cDNA-Chip）; cDNA library normalized ;基因组芯片（genomic chip) Why Genomic Biochips?;与表达芯片相结合，完整的理解疾病的进程 （Combined with expression chips, gives full understanding of disease process）; 5月8日北京本元正阳基因技术股份有限公司 研制出SARS病毒全基因组芯片检测系统 ; SARS病毒全基因组芯片覆盖了病毒基因组的全部序列 试用于SARS病毒的早期检测，并全面监测该病毒基因组的变化。 包括分析世界各地分离株之间的差异、病毒在传播过程中可能发生的变异以及追索病毒来源;Assay Formats of Genomic and Expression chip; 把蛋白质点阵到经化学方法或酶、受体、抗体等生物学方法处理过的固体表面, 通过衡量与芯片表面的亲和力来分析未知分子。;蛋白芯片与基因芯片的原理相似; MacBeath G and Schreiber S L，2000 哈福大学率先报道了蛋白质芯片的尝试性工作;第一个包含一种生物全部蛋白质分子的蛋白质芯片----酵母蛋白质组芯片（耶鲁大学 Zhu等，2001 ）;A：蛋白质质量检测 B: 包含6556条蛋白质的芯片杂交结果 C:蛋白质芯片杂交结果局部放大图; 这种只有两英寸大小的蛋白质芯片已由深圳益生堂生物企业有限公司投产。 只需要２微升（一滴血的十分之一）血清或血浆，１小时后就能检测出结果。而每次的检测费用只有100元左右。 ;2003年5月,中科院上海生命科学研究院宣布研制出SARS蛋白质芯片检测系统，其包含SARS病毒五种主要结构蛋白质——N蛋白、E蛋白、S蛋白、M蛋白和3CL蛋白的抗原，以及相应的配套对照蛋白, 对送检血清样品进行检测。获得检测结果大约需1个半小时. 台大医学院医研制出肿瘤蛋白质芯片, 其包括肺癌、乳癌、大肠癌及口腔癌 等四种肿瘤的生化标记，目前筛检的准确率将近八成，虽然无法借此确定肿瘤的发生部位，但是可以当成临床诊断癌症的参考。;抗体芯片（Antibody Microarray，Ab Microarray ） ; 芯片上排列了378种已知蛋白的单抗(Ab Microarray 380), 这些单抗对应的蛋白都是细胞结构和功能上十分重要的蛋白，涉及信号传导、肿瘤、细胞周期调控、细胞结构、细胞凋亡和神经生物学等广泛的领域。;抗体芯片的操作流程;The Ab Microarray Protocol; ;根据芯片表面化学修饰物的不同 ;多聚赖氨酸芯片（Poly-L-Lysine）;氨基修饰玻片（Amino Silane/Silanated）;醛基修饰芯片（Aldehyde/Silylated） ;生物芯片的分类（3） ;第一， DNA样品以共价键的形式结合在处理过的玻片上。 第二，玻璃是一种耐用的材料，能够耐高温和高离子强度溶液的洗涤。 第三，玻璃不是多孔材料，使杂交的容量能保持在最小，因此能提高探针与目标分子的退火效率。 第四，由于材料的低荧光性，不会有背景的影响。 第五，两种不同的探针能够标上两种不同的荧光标记，在一片芯片上同一个反应中同时孵育；尼龙就受到连续或平行杂交的限制。 ;有机芯片;生物芯片的分类（4）;基因表达分析芯片;DNA测序芯片;芯片实验室;芯片实验室为高度集成化的、集样品制备、基因扩增、核酸标记及检测为一体的便携式生物分析系统 它最终的目的是实现生化分析全过程全部集成在一片芯片上完成，实现生物分析过程自动化、连续化和微缩化 属未来生物芯片的发展方向。 ;生物芯片的分类（5）; 在片/原位合成法（on chip/in situ synthesis）， 即在支持物表面原位合成寡核苷酸探针），适用于寡核苷酸芯片;制备单个探针