蛋白质折叠的计算机模拟研究进展-北京工业大学学报.PDFVIP

第43卷 第12期 北 京 工 业 大 学 学 报 Vol.43 No.12 2017年 12月 JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OFTECHNOLOGY Dec. 2017 蛋白质折叠的计算机模拟研究进展 1 1 2 2 苏计国 ,王韦卜,陈慰祖 ,王存新 (1.燕山大学理学院河北省微结构材料物理重点实验室,秦皇岛摇 066004; 2.北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京摇 100024) 摘摇 要:蛋白质折叠是结构生物学领域有待解决的重要科学问题,计算机模拟方法是研究蛋白质折叠的主要手段 之一. 对蛋白质折叠的计算机模拟研究进展进行了简要介绍,主要内容包括:全原子分子动力学模拟、G侪模型以及 弹性网络模型的主要思路及其在蛋白质折叠研究中的应用. 关键词:蛋白质折叠;分子动力学模拟;G侪模型;弹性网络模型 中图分类号:U461;TP308 文献标志码:A 文章编号:0254-0037(2017)12-1818-10 doi:10.11936/ bjutxb2017060036 Research Progress in Computer Simulations of Protein Folding 1 1 2 2 SUJiguo ,WANG Weibu ,CHEN Weizu ,WANG Cunxin (1.Key Laboratory for Microstructural Material Physics of Hebei Province,School of Science, Yanshan University,Qinhuangdao066004,China; 2.College of Life Science and Bioengineering,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China) Abstract:Protein folding is an unsolved important scientific problem in the field of structural biology. Computer simulation isone of the main methodsfor the study of proteinfolding. Theresearch progressin the computer simulations of protein folding was briefly introduced. The main contents in this paper include:the primarily methods of all鄄atomic molecular dynamics simulation, G侪 model and elastic network model,aswell as their implications in the study of protein folding. Key words:protein folding;molecular dynamics simulation;G侪 model;elastic network model 摇 摇 蛋白质是生物体内最为重要的生物大分子之 待解决的重要科学问题之一. 蛋白质折叠问题包含 一,是生物体各种生命活动的具体执行者,发挥着重 2个层面的内容:特定蛋白质序列会折叠