第一章 蛋白质组成及结构.ppt

蛋白质部分 第一章 蛋白质组成及结构 第一节 组成蛋白质的氨基酸 第二节 蛋白质的一级结构与进化 第三节 蛋白质的空间结构 第四节 蛋白质各级结构之间的关系 第五节 球状蛋白质构象的运动 第一节 组成蛋白质的氨基酸 根据侧链结构和性质的不同分为： 1. 脂肪族氨基酸 2. 芳香族氨基酸 3. 羟基氨基酸与含硫氨基酸 4. 酸性氨基酸及其酰胺 5 . 碱性氨基酸 另外，蛋白质中还常含有修饰氨基酸 1. 脂肪族氨基酸 甘氨酸 （Gly, G） 亮氨酸 （Leu, L） 丙氨酸 （Ala, A） 异亮氨酸（Ile, I ） 缬氨酸 （Val, V） 脯氨酸 （Pro, P） Gly Ala 小，侧链只有一个甲基 无化学活性 在蛋白质分子中可处于 内部或表面 Val、 Ile、 Leu  带有分支的支链氨基酸 易于在蛋白质分子中固定于一定位置，并有利于链的折叠 Pro 一种亚氨酸 具有固定的构型，很强的立体化学效应 使肽链形成一个转角而改变主链方向 对二级结构有破坏作用，但仍能出现在这些结构末端或弯曲部位 常暴露于蛋白质分子表面 以顺式肽键存在 2. 芳香族氨基酸 Phe、Tyr、Trp Phe 疏水作用很强，而 Tyr、Trp 较差。 Tyr 酚基可形成较强的氢键 Cα与芳环之间仅有一个可转动的 C? 甲烯基，限制了侧链的柔性 侧链环堆积不规则，常以相互垂直的“人”字型排列，其存在形式对周围结构有很大影响 3. 羟基氨基酸与含硫氨基酸  Ser、 Thr 侧链带有羟基，可形成氢键, 也可通过水分子间接形成氢键 化学性质活泼，具有重要的功能 Cys 巯基（–SH） 易氧化形成带有二硫键的半胱氨酸 与金属离子如 Fe、Zn、Cu 等配位结合 结合蛋白质中一些非蛋白基团 在蛋白质空间结构中成簇聚集 因此 常埋藏在蛋白质分子内部，形成特定的模体结构 Met 疏水性大 柔性大 常埋藏在蛋白质分子内部 4. 酸性氨基酸及其酰胺 天冬氨酸（Asp, D） 谷氨酸 （Glu, E） 天冬酰氨（Asn, N） 谷氨酰氨（Gln, Q） Asp 、 Glu 一般带负电荷， 在蛋白质内形成盐键 Glu的γ羧基 常位于蛋白质分子表面，与钙结合 在肽段序列中成簇存在，使分子表面形成不对称电荷分布 从而成为蛋白质分子与其他大分子物质相互作用的位点 Asn、Gln 侧链虽有极性，但不解离，不带电荷 易形成氢键 5 . 碱性氨基酸  组氨酸（His, H） 赖氨酸（Lys, K） 精氨酸（Arg, R） His 含咪唑基 参与酶促反应中的质子传递反应， 为多种酶的活性中心 易与金属离子形成配位化合物， 参与组成各种金蛋白属质 Lys、Arg 一般带正电荷，存在于蛋 白质分子表面 可与酸性氨基酸残基、 肽链 C 端、核酸中的磷酸基 团形成盐键 与蛋白质活性有关 Lys 长侧链可自由伸展在外，与蛋白质结合功能有关 Arg 可沿着侧链卷曲成疏水表面埋藏在蛋白质分子内，也可与蛋白质分子内的氧形成氢键从而稳定蛋白质，与酶的催化功能有关 修饰氨基酸 翻译后修饰：即肽链中氨