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生物化学-4-蛋白质

Here comes your footer 生物化学-4-蛋白质 王强 第一部分 氨基酸(amino acid, Aa) 一、氨基酸—蛋白质构件分子 二、氨基酸的分类 三、氨基酸的酸碱化学 四、氨基酸的化学反应 五、氨基酸的光学活性和光谱性质 六、氨基酸混合物的分析分离 蛋白质水解 蛋白质和多肽的肽键与一般的酰胺键一样可以被酸碱或蛋白酶催化水解,酸或碱能够将多肽完全水解,酶水解一般是部分水解. 多肽是由氨基酸以酰胺键形式连接而成的线性大分子。它在生物体内可以单独存在,但是更多的则是作为蛋白质的组成部分。蛋白质是由一个或多个多肽链通过共价键(主要是二硫键)或非共价力结合而成。应用化学或物理方法,可以将蛋白质拆分成多肽组分。 完全水解得到各种氨基酸的混合物,部分水解通常得到多肽片段。最后得到各种氨基酸的混合物。 所以,氨基酸是蛋白质的基本结构单元。 大多数的蛋白质都是由20种氨基酸组成。这20种氨基酸被称为基本氨基酸。 1 酸水解 常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫酸在105-110℃条件下进行水解,反应时间约20小时。 此法的优点是不容易引起水解产物的消旋化。缺点是色氨酸被强酸完全破坏; 含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;门冬酰胺和谷氨酰胺侧链的酰胺基被水解成了羧基。 2 碱水解 一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。 由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。 部分的水解产物发生消旋化。 该法的优点是色氨酸在水解中不受破坏。 3 酶水解 目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶(proteolytic enzyme)或称蛋白酶(proteinase)已有十多种。 应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。水解的产物为较小的肽段。 最常见的蛋白水解酶有以下几种: 胰蛋白酶(trypsin) 胰凝乳蛋白酶 胃蛋白酶(pepsin) ? -氨基酸的一般结构 除脯氨酸及其衍生物外,氨基酸(Aa)在结构上的共同点:与羧基相邻的?-碳原子上都有一个氨基,因此称为?-氨基酸;连接在?-碳上的还有一个氢原子和一个可变的侧链,称R基,各种氨基酸的区别就在于R基的不同。 AA在中性pH时,羧基以-coo-,氨基 以-NH3+形式存在。这样的AA分子含 有一个正电荷和一个负电荷,称为 兼性离子。?-AA除R基为氢(甘氨 酸)之外,其?-碳原子是一个手性 碳原子,因此都具有旋光性。并且都是L型的AA。 一、氨基酸—蛋白质构件分子 二、氨基酸的分类 三、氨基酸的酸碱化学 四、氨基酸的化学反应 五、氨基酸的光学活性和光谱性质 六、氨基酸混合物的分析分离 常见的蛋白质氨基酸 蛋白质氨基酸:参与蛋白质组成的20种氨基酸称为蛋白质氨基酸。 1、按R基的极性性质,20种常见AA可以分成4组: 非极性R基AA(nonpolar) 不带电荷的极性R基AA ( polar ) 带正电荷的R基AA 带负电荷的R基AA 非极性R基AA:共8种AA 不带电荷的极性R基AA:共7种AA 带负电荷的R基AA:共2种AA 带正电荷的R基AA:共3种AA 2 按R基的化学结构20种常见AA可分: 芳香族:Phe,Tyr,Trp 杂环族:His,Pro 不常见的蛋白质氨基酸 有些氨基酸虽然不常见但在蛋白质中存在,它们大都是由相应的常见Aa经修饰而来。 e.g. 5-羟基赖氨酸、4-羟脯氨酸 非蛋白质氨基酸 此类Aa大多是蛋白质中存在的L型?-氨基酸的衍生物。 一、氨基酸—蛋白质的构件分子 二、氨基酸的分类 三、氨基酸的酸碱化学 四、氨基酸的化学反应 五、氨基酸的光学活性和光谱性质 六、氨基酸混合物的分析分离 Aa的兼性离子形式 1.Aa晶体是由离子晶格组成, 像氯化钠一样,维持晶格中质点间的 作用力是两性电荷之间的静电吸引,作用力较强,晶体熔点高。 2.偶极离子形式的Aa是强极性分子,增大了水溶液系统的介电常数。 Aa的解离 Aa的等电点 当溶液浓度为某一pH值时,氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等,净电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点,简称pI。在等电点时,氨基酸既不向正极也不向负极移动,即氨基酸处于两性离子状态。 侧链不含离解基团的中性氨基酸,其等电点是它的pK’1和pK’2的算术平均值:pI =(pK’1 + pK’2 )/2 同样,对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其pI值也决定于两性离子两边的pK’值的算术平均值。 酸性氨基酸:pI =(pK’1 + pK

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