基于BRB-ArrayTools和GATHER工具对膀胱癌相关基因的挖掘及生物信息学分析.pdfVIP

基于BRB-ArrayTools和GATHER工具对膀胱癌相关基因的挖掘及生物信息学分析.pdf

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· · 11 852 JournalofClinical 2011,Vol26,No Urology,Nov ·实验研究· 相关基因的挖掘及生物信息学分析 李飞1 梁中锟1 荆玉明1 石小军1 陈三三1 万沛1 谭万龙1 [摘要] 目的:从分子水平探讨膀胱癌的发病机制,为临床诊疗提供新思路。方法:从公共基因芯片数据库 GATHER分析发现这些差异基因的功能主要集中在细胞的生理过程、细菌凝聚反应的诱导作用、Jak—STAT和 Toll—like受体的信号通路及细胞因子相互作用等生物学过程。结论:利用生物信息学方法能有效分析基因芯片 数据并获取内在信息,为确定膀胱癌的早期诊断标志与治疗靶点提供新的思路。 ArrayTools软件 [关键词]生物信息学;膀胱癌;基因表达谱;BRB doi:10.3969/j.issn.1001—1420.2011_11.020 [中图分类号]R737.14[文献标识码]A [文章编号]1001—1420(2011)11—0852—04 ofBladderCancer-related andBioinformaties Data—mining Analysis Tools GenesBasedon andGATHER BRB—Atray L11 SHll Fei LIANGl JINGl Zhongkun Yuming Xiaojin CHENlWANl TANl Sansan Pei Wanlong (1 SouthernMedical DepartmentofUrology,NanfangHospitalof 510515,China) Abstract themolecular ofbladdercancer,andnovelmeansfor explore pathogenesis provide Objective:To clinical andtreatmentofthis dataofwhole ofblad— diagnosis malignancy.Methods:Thegenomicexpressionprofiles wereobtainedfromGE0database.Differentialwereidentified Toolssoftware, dercancers genes byBRB-Array resultsshowedtherewere122differ— then GATHERtoolforbioinformatics analysis using analysis.Re

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