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rep-PCR对赤杨根瘤内Frankia菌基因多样性研究
摘 要
本文应用重复基因外回纹序列 rep-PCR方法直接扩增长白山三种不同赤杨
和云南不同地区早冬瓜根瘤内的Frankia菌基因,所获得的REP指纹图谱揭示
Frankia菌具有丰富的基因多样性。研究结果表明Frankia菌多样性随地域,海
拔,坡向不同而变。多样性指数与自然选择压力大小成正相关。自然选择压力是
产生和保持Frankia菌基因多样性的重要因子。同时发现 Frankia菌基因型与地
域有紧密关系。所观察的云南各地区中,感染高黎贡山旱冬瓜的Frankia菌基因
多样性最为丰富。推测与高黎贡山旱冬瓜共生的Frankia可能作为种储备库,为
其它地区的寄主植物提供了祖先菌株。
在对长白山三种赤杨 (东北赤杨,西伯利亚赤杨和色赤杨)根瘤内Frankia
菌基因多样性考察过程中发现,Frankia菌基因类型与寄主赤杨种型关系密切。
同时海拔对感染东北赤杨的Frankia菌基因多样性也有一定影响。感染西伯利亚
赤杨和色赤杨的Frankia菌享有相同的基因型,可能有较近的亲缘关系。
关键词:赤杨,基因多样性,Frankia,
Abstract
TheStudyonGeneticDiversityofFrankiaStrainsinthe
nodulesofAInusbyrep-PCRtechnique
ThegeneticdiversityoftheAlnus-infectiveFrankiastrainswas
studiedbyrep-PCR(RepetitiveExtragenicPalindromic)technique.The
genomicDNAs,isolatedfromFrankiastrainsinthenodulesofAlnus,were
amplifieddirectly.ThesamplescollectedarethoseFrankiastrains
symbiosingwithAlnusnepalensisinYunnanProvinceandwiththreespecies
ofAlnusgrowinginChangbaiMountain,whichareAlnustinctoria,A.
mandshuricaandA.sibiricarespectively.TheresultingREPfingerprint
patternsobtainedrevealthatFrankiahasanabundantgeneticdiversity.
ThediversityofFrankiastrainsgrowingindifferenthabitatsofJizu
andWuliangMountainsvarieswithdifferentzones,altitudesandslopes.
Thediversityindexispositivelyrelatedtonaturalstress,andthelatter
isthemainfactoraffectingtheproduceandmaintenanceoftheFrankia
geneticdiversity.ForalloftheregionssampledinYunnanProvince,
genotypesappeartobeendemictotheirregionsexceptforthosefrom
GaoligongMountain,inwhichFrankiahasthemostgenotypesandhighest
diversityindexamongthefiveregions.ItisconcludedthatFrankia
strainssymbioticallyassociatedwithAInusnepalensisgrowing in
GaoligongMountainperhapsarethegeneticstoreroom,whichoffersother
actinorhizalplantshabitatinginotherregionsancestorstrains.
DuringstudyingthegeneticdiversityofFrankiastrainssymbiotically
associatedwithAln
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