中科院 土壤新技术 第四讲.ppt

第二章：土壤学研究新技术与新方法各论 第一节：土壤学研究信息获取新技术与方法 第二节：土壤学原位取样新技术与方法 第三节：土壤学研究原位观测技术与方法 ;一、根系研究法 （一）根系的田间观测法;（二）模拟观测法;（二）近代根系的一些研究方法;现有的根系研究方法通常分成取样和测量二步进行。 从根系形态研究的需要出发，要求取得的根系是完整的，至少涉及研究目的的主要根系不得断缺；而且，还应保持其在介质环境中的原状不变形、不移位，要求采样工作快速、准确。 根系研究中另外一个基础性的、关键性的工作就是对根系的有关参数进行准确的测定。根系结构分枝繁多，粗细不一，相互遮挡、交叉，柔软易动，且离土后易脱水变形。因此，要对根系进行准确的原位测定其难度很大。;现有的根系观测方法，需要先进行破坏性取样，使根系与土壤分离开来；然后进行人工测量，或借助于专用仪器逐项对有关形态参数(多数是平面数据)进行人工辅助测量，整个取样和测量过程既耗时费力、又存在较大误差，很难实现根系的原位取样和准确测量，容易出现移位、有断根和水分逸失等问题。 少数几种非损伤性方法，包括同位素示踪法、地下根室及微根室的研究等，尽管不需要破坏性取样，避免了耗时费力的取样程序，但只能获得一些有限的原位观测数据，难以获得完整、准确的三维形态数据;6、多层螺旋CT原位观测植物根系技术 （1）特点：原位、快速、准确、无损 ;（3）影响因素： 扫描方案的影响 不同的扫描方案对根系样品的成像质量有明显的影响，主要的扫描技术参数有X线剂量、层厚、层距等。根据前期试验结果，本次试验选取的主要扫描参数为：层厚1 mm，层距1 mm。扫描方案的影响从根本上讲主要取决于成像设备(硬件)的性能，用单螺旋CT扫描同样的根系样品，无论是原始的断层图像还是重建后的三维立体影像，根本分辨不出根系样品和介质环境。 ;成像方案(方法)的影响 对同一根系，有的成像方案能够清晰地显示出细微根系，而有的只能显示出主根的轮廓，很难分辨介质环境和根系的边界。 现有的医用CT成像方案难以实现根系与介质环境的彻底分离，显示出完全只有根系的三维影像。 三维重建图像中出现的大大小小的白色斑点，实际上是介质中密度与相应根系密度极为接近的成分，利用医用CT成像方案难以将其与根系影像彻底分割、完全去除。为此，有必要针对根系这一有着特殊形态结构的植物组织器官，研究适宜的图像分割与三维重建算法，以获得更加清晰的影像。;最大密度投影(a----MIP)、表面遮盖成像(b----SSD) 容积再现(c---VRT)、多平面重构(d----MPR);介质因素的影响;有机土与细砂中根系成像质量差异主要原因是由于介质密度不同造成图像对比度不同。 评价CT图像质量最重要的参数，对比度主要是由于不同密度的物质对X射线衰减程度的差异引起的。a中大豆根系与有机土的密度比为1：0.36，图b中大豆根系与细砂的密度 比仅为1：1.06。正是由于大豆根系与细砂介质问的密度非常接近，才使得图像难以有效分割，这是造成成像质量差的主要原因 ;根系因素的影响 在相同的成像技术条件和生长介质条件下，对比不同植物根系的成像效果，3种样品中榕树苗根系成像质量较好，大豆根系和西红柿根系的成像质量则较差。不同根系成像质量差异的原因除了根系密度不同造成根系与介质密度对比的差异外，可能与根系的组成成分也有关系。;7、微根窗技术（Minirhizotron)在植物根系研究中的应用;(1)微根窗系统的组成;早期的微根窗研究比较简单, 收集到的数据量少, 随着光学和电子学的发展, 从微根窗收集到的数据和信息量大幅度增加, 使微根窗技术得到了长足的发展。 目前, 一个典型的微根窗系统是由一个插入土壤中的微根窗管、摄像机、标定手柄、控制器和一台计算机组成(Vamerali T et al.1999; Patena G, 2000; Johnson MG et al., 2001);(2) 　微根窗管的组成与安装 微根窗管组成： 微根窗管是微根窗系统的一个重要组成部分, 一般是透明的玻璃或塑料管。 管子的形状通常是圆形的( Brown DA, et al.,1987), 但也有方形管(Van Noordwijk M et al., 1985);膨胀管(Gijsman AJ et al., 1991)或加压管(Merrill SD et al., 1992)也通常被使用。 微根窗管一般由树脂玻璃、丁酸盐纤维素(CAB)、聚碳酸脂、丙烯酸树脂和玻璃制成。对材料的选择基于成本和实用性。 微根窗管必须是密封的, 地上部是绝缘的, 并将其涂成黑色以减少管子的热量传导, 同时盖上不透光的盖, 避免光的射入影响根系生长（Levan MA e