种子发育相关B3基因的起源和进化The origin and evolution of the B3 gene related to seed development.pdfVIP

目录 摘 要 ……，……l A b strac t…… 111 第 一章 引言……1 1.1 种子形 成和 发育 ……1 1.1.1 种 子 形成 和 发育过程 概述 ……1 1.1.2 种 子成 熟 发育调 控 网络 ……，……2 1.2 基 因家族 的形成与进 化 ……3 1.3 B 3 超 家 族 A FL 亚家族 基 因与种子 发育 ……4 1.4 本项研 究 的 目的与 意义 ……，……7 第二 章 A FL 亚家族 B 3 基 因的起 源 与分子进 化研 究 ……9 2.1 材料 与方法 ……9 2.1.1 研 究材料 ……9 2.1.2 序 列获取 ……9 2.1.3 序 列 比对 和基 因结构域 分析 ……11 2 .1.4 A FL 亚 家族 B 3 基 因 内含 子 丢 失和 插入 分析 ……11 2.1.5 系 统 发 育 分析 ……11 2.2 研 究结果…… ..‘……13 2.2 .1A F L 亚 家 族 成 员 在 陆生 植物 基 因组 中的分布 ……13 2.2.2 A FL 亚 家族成 员 的系 统 发育关 系分 析 ……14 2 .2 .3 A F L 亚 家 族 成 员保 守 区差异 分析 ……，……20 2.2.4 A F L 亚 家族成 员外显 子 一内含 子 结构变化 分 析 ..…，……23 2 .3 讨 论 …，……，……26 2 3.1A F L 亚 家族 B 3 基 因 的起 源 与 陆生 植物 主 要类 群 系 统 发生 的关系 26 2 .3.2 A FL 亚 家族进 化 史 中 的基 因重 复和 分化 式 样 ……26 2.3.3 A FL 亚 家族成 员保 守结构域 数 目逐步减少 的潜 在 意 义 ……27 2 .3.4 禾 本科 植 物 中 A F L 亚 家族 B 3 基 因的结构 与功 能分 化 分 析 ...……28 第 _ 几章 裸 子 植 物 草 因组 中 A F L 亚 家 族 B 3 基 因 的妇“增 ……犯 3.1 引 台-……，……，..……32 3.2 材 料和 方法 ……犯 3 .2 .1 研 究材料 ……犯 3 .2 .2 总 D N A 提 取 ……32 3.2 .3 PC R 扩 增 和测 序 ……33 3.3 实验 结果……40 3.3.1 松 杉 纲 植 物 A F L B 3 基 因扩 增 结 果 ……40 3.3.2 银 杏 A FL B 3 基 因扩 增 结 果 ……43 3 .4 讨 论 ……4 7 第 四章 结论 与展望 ……，……48 参 考 文 献 ……49 附录 工植 物 基 因组 中 A FL 亚家族 B 3 基 因 的相 关 信 息 ……62 附录 11裸 子 植物 A F L 基 因 1人IL 一P C R 扩 增 序 列 ……64 附录 m 攻 读 硕 士 学 位 期 间 已发表 论 文 ……，…… “ 致 谢 ……81 摘 要 种 子 形成 (seed form ation ) 是 陆生植 物进 化 的关 键 创 新 (key innovation ) 之 一 ，也 是种 子 植物 广 泛适应 不 同陆地 环 境井 发展成 为 陆地 植被 主要 类 群 的基 础 。从系统发育 的角度 看 ，种 子 的形 成 实 际是 由于在 高等植 物 生活 史 中、在胚 胎 发生 的后期插 入 了一 个成 熟 阶段所致 。B 3 类 转 录 因子 在植 物 基 因组 中形成 一 个超 家族 ，包括 : LA V 家族 、A R F 家族 、RA V 家族和 R EM 家族 ，其 中 LE CZ 、 F 口S 〔习3 和 A B I3/VP 了隶 属于 L A V 家族 、A