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武汉生物工程学院课程考试试题 2012-2013学年第二学期课堂测验 课程名称：生物信息学 使用班级：10生工、生技钱班 考试方式：开卷 考试时间：50分钟 一、填空题（每题1分，共30分） 1. 生物信息学三大核酸序列网站是 、 和 ，基因组浏览器有 。 2. 数据库常用的数据检索工具有 、 和 。 3. 生物信息学常用的软件有 、 和 ；常用引物设计软件有 ；常用系统发育分析软件有 ；常用多序列联配的软件有 。 4. 引物设计最常用的软件有 和 。DNAMAN软件的主要作用有　 和 。 5. 蛋白质三级结构预测的主要方法包括 、 和 。 6. 系统发育树根据树的具体表达形式分为物种树和 。系统发育树的构建方法有 、 。 7. 蛋白质一级结构是指 ，二级结构基本单元包括 、 。 8. 成熟的microRNA长度约 个碱基，其前体双链RNA通常具有 结构，在细胞核内经 切割，抑止基因的表达。 9. 多序列比对的工具有 和 。 二、选择题（每题1分，共20分） 1 以下哪一个是mRNA条目序列号： A. J01536 B. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB134506 2 Refseq和GenBank有什么区别： A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列 B. GenBank提供的是非冗余序列 C. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息 D. GenBank源于Refseq 3如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择： A. OMIM B. Entrez C. PubMed D. PROSITE 4直系同源定义为： A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列 B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列 C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列 D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列 5如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列： A. 1 B. 2 C. 3 D. 6 6要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序列，应选择： A. blastn B. tblastn C. tblastp D. blastx 7系统发生树的两个特征是： A. 进化分支和进化节点 B. 树的拓扑结构和分支长度 C. 进化分支和树根 D. 序列比对和引导检测方法 8蛋白质编码区域占人类基因组百分比是： A. 1-5% B. 5-10% C. 10-20% D. 20-4-% 9第一个被完整测定的基因组序列是： A. 啤酒酵母的3号染色体 B. 流感病毒 C. ФX174 D. 人类基因组 10构建进化树最直接的错误来源是： A. 多序列比对错误 B. 采样的算法差异 C. 假设进化分支是单一起源 D. 尝试推测基因的进化关系 11下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法： A. 邻位连接法（NJ法） B. Kimura算法 C. 最大似然法（ML） D. 非加权平均法（UPGMA） 12下列不能用做系统发育分析的软件有（ ） A. Clustal X B. Oligo 6 C. MEGA D. AMOVA 13从头预测真核基因的原因有（ ） A. 外显子/内含子边界难以确定 B. 内含子长度可能只有几个碱基对 C. 编码区域的GC含量并不总是与非编码区相同 D. 以上三个方面的原因 14下列不属于三大核酸序列数