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cDNA基因芯片技术研究血管内皮细胞基因变化的质量保证过程
张曼王京李莉
(北京世纪坛医院100038)
【摘要】目的探讨cDNA基因芯片技术在应用过程中如何排除干扰，保证分析质量，获
得进一步归纳分析的有效数据。方法通过排除非特异本底、点样均一误差、非特异错配、
同源组织错配等各方面因素，应用10368个基因的eDNA基因芯片研究人冠状动脉血管内
皮细胞基因表达的总体变化趋势和不同功能集团间的分析，逐步分析不同干扰因素，获得有
效处理数据。结果三次重复实验中10368个基因芯片反应数据分别排除89、132和116个
低于非特异本底荧光强度的杂交点，281、368和220个少于荧光杂交面积10％的不确定杂
l
交反应，1 13、1026和1096个不同种属间非特异错配，重复性筛选等因素，获得相对有效
个数据。结论基因芯片技术在应用过程中受许多因素的影响，经过切实有效的方法排除干
扰因素，可获得较具有客观性的结果，是进一步分析的必要前提。
【关键词】基因芯片，数据说明，统计，荧光杂交
ofinterferedfactorsabouteDNA ofhuman
Analysis microarraystudyinggeneexpression
vascularendothelialcellsHANG Li．LIU ofclinical
Man，WANGJin，LI Zong—Zheng．Center
General of
laboratory,Beijing，ShijitanHospital(RailwayHospitalBeijing)．
To themethodfordata of aboutvascular
[Abstract]Objective analysis expression
study gene
endothelial cDNA fromthestateor of
cells
using microarray，Toprevent qualitybeingincapable
of adesiredeffectorresult．we thedatathatcauseinterferenceinthe
producing analyzed special
usedhumancardiovascular-basedcDNA
and factors．MethodsWe a microarray
nonspecial
1 0368 the errorand
mis·hybrization
containinggenes，Removednon-specialbackground，spoting
to the and
betweensameanddifferentstrain．ResultsInorderdetract
backgroundintensity,noise
scale remove 32andI 1 6 220 thatdedvedfromthe
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