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第九章 标记-2
第三节 核素标记 标记核酸的核素有32P、33P、35S、3H等; 以 [α 32p]-dNTP为标记物 3.1 双链DNA探针 3.1.1切口平移法 原理:同前(DIG-II-dUTP) 3.1.2 随机引物介导法(延伸法) 原理:同DIG-II-dUTP 试剂: ?模板:变性的闭环DNA或线性DNA ?随机引物:可购买或自制 ?前体:dNTP,其中一种为α -32p标记 ? DNA聚合酶:可用E.coli DNA聚合酶I的klenow大片段 第四节 探针的纯化 探针被用于原位杂交时,必须进行纯化,以除去未标记的同位素或非同位素。 常用的纯化方法包括: ?萃取/沉淀法: ?层析法: ?离心法: ?电泳法:鉴定 4.1 乙醇沉淀法 原理:DNA或RNA可被乙醇沉淀,而未掺入的小分子dNTP保留于上清液中,反复乙醇沉淀,可分离之。 4.2 层析法 4.2.1 Sepharose CL-4B柱层析 用于快速分离核苷酸探针(150bp) 4.2.2 Sephadex G-50或G-25柱层析 排阻极限: G-25柱:10-12bp G-50柱:72bp 旋转色谱柱: ?原理: 离心与过滤法结合, 可快速去除小分子未标记物(包括:核素、非核素,NTP、缓冲离子) ?操作: 装柱→离心(去除柱中缓冲液)→上样→离心(收集DNA/RNA)→洗脱 第五节 探针的鉴定 探针鉴定的内容: 长度测定 示踪物的掺入率 测定方法: 杂交法 酸沉淀法 层析法 5.1 杂交法 步骤: 1)印迹: ?将靶核酸溶于TE缓冲液中,点样于NC膜或尼龙膜上; ? 或Southern/Northern印迹:将靶核酸点样于琼脂糖凝胶上,电泳→ 印迹转移至NC膜上; 固定核酸:80℃ 烘箱 ,0.5-2hr 2) 杂交:将探针与NC膜上的靶核酸杂交 方法:见《生化实验方法和技术》p317 3)检测: 化学发光法 酶联免疫法 放射自显影系统(核素) 印迹术: Southern blot:1975年,Southern 发明DNA印迹术; Northern blot:1977年,RNA印迹术; Western blot:1979年,蛋白质印迹术; Eastern blot:双向蛋白质印迹术。 5.2 酸沉淀法 原理: 大于20个核苷酸长度的DNA或RNA分子,在强酸溶液中能被定量沉淀出来,前体小分子dNTP /NTP被留溶液中。 ?用第二张滤膜收集沉淀(洗涤试管,重复4次,收集)→ 用3ml乙醇洗涤(去除前体小分子); ?二张滤膜浸入含甲苯的闪烁液中,用闪烁计数仪测放射强度。 第一张为X1(总放射强度),第二张为X2(标记放射强度) 第六节 蛋白质(酶、抗体)标记 蛋白质的标记可采用: ?酶 ?荧光染料 ?生物素 ?有色金属试剂 6.1 酶标记 用于标记抗体的酶有: ?辣根过氧化酶(HRP) ?碱性磷酸酶(AKP) ?半乳糖苷酶 由抗体-酶制成偶联体(特异性探针),应用十分广泛。 6.1.1 辣根过氧化酶(horse radish peroxidase)HRP HRP: ?植物中研究最透彻的一种过氧化物酶; 偶联方法: 1)过碘酸盐法: 2) 戊二醛法: 6.1.2 碱性磷酸酶(AKP) 一步法: 由戊二醛偶联AKP与IgG 6.1.3 半乳糖苷酶 ?戊二醛法 ?间位-马来酰亚胺苯-N-羟基琥珀酰亚胺酯(MBS) 连接IgG中游离氨基与蛋白质中的半胱氨酸 6.2 荧光染料标记(制备方法不作要求) 常用的荧光染料有: 荧光素(fluorescien) 罗丹明(rhodamine) 德克萨斯红(texas red) 藻红朊(rphycoerythrin,PE) 四甲基罗丹明(tetramethyl rhodamine) 6.3 生物素标记 原理: 蛋白质与小分子生物素偶联后,不会改变其活性。 1)生物素标记抗体: 用生物素琥珀酰亚胺酯(可购买)→ 标记 2)生物素标记蛋白质: ?生物素-羟基琥珀酰亚胺(BNHS): ?生物素马来酰亚胺: ?生物素肼: 6.4 金标记 原理:金粒与抗体偶联,在电镜下观察胶体金颗粒(根据金粒的电子密度特征) 6.5 核素标记 1)32P正磷酸盐 2)[r 32P] 或〔r 33P〕-ATP: 通过蛋白质的磷酸化来标记 3)3H,14C,125I:标记底物 探针信号的检测: 酶法检测; 荧光检测; 化学发光检测 本章小结: 核酸探针标记 非核素标记(DIG、生物素) 核素标记(32P) 探针的纯化 探针的鉴定 蛋白质(酶、抗体)标记 核酸探针标记(DIG标记): ?双链DNA探针的标记: ?随机引
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