枸杞胆碱合成关键酶基因PEAMT的克隆及生物信息学分析研究.pdfVIP

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2018-01-15 发布于广东
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枸杞胆碱合成关键酶基因PEAMT的克隆及生物信息学分析研究.pdf

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第 31卷第 1期上海交通大学学报 (农业科学版) Vo1．31No．1 2013年 2月 J0URNAL0FSHANGHAIJIA0T0NGUNIVERSITY (AGRICULTURALSCIENCE) Feb．2O13 文章编号：1671—9964(2013)01—0001—07 DOI：10．3969／J．ISSN．1671—9964．2013．01．001 枸杞胆碱合成关键酶基因PEAMT的克隆及生物信息学分析王名雪，陆平。，许菲，潘琪芳，唐克轩，赵静雅 (1．上海交通大学农业与生物学院，上海 200240；2．华南理工大学生物科学与工程学院，广州 510006) 摘要：利用RT-PCR和RACE结合的方法，获得了枸杞磷酸乙醇胺 N_甲基转移酶PEAMT基因cDNA全序列(命名为LbPEAMT)。LbPEAM丁cDNA全长 1863bp，开放读码框 1497bp，编码一个由498个氨基酸构成的多肽，理论分子量为56．53kDa，等电点pI为5．50。通过多种序列比对，该基因编码的氨基酸序列与番茄 PEAMT氨基酸的相似性为 93 。二级结构预测 LbPEAMT蛋白由44．98 的a一螺旋、17．67 的延伸链、6．63 的J3一转角和30．72 的不规则卷曲组成。LbPEAMT是一个亲水蛋白。含有2个腺苷甲硫氨酸依赖催化活性结构域，分别位于N 端65—164aa和C端290—392aa。每个活性区都包含有 4个部分基序，分别为I、postI、postII和 postIII。LbPEAMT的这2个活性区在蛋白、磷脂和小分子甲基转移酶中都是相对保守的。关键词：枸杞；胆碱合成酶；磷酸乙醇胺N一甲基转移酶(PEAMT)；基因克隆；生物信息学分析中图分类号：Q943．2 文献标识码：A CloningandBioinformaticsAnalysisofCholineBiosynthetic Gene PEAMT inLycium barbarum WANGMing—xue，LUPing。，XUFei，PANQi一知ng ，TANGKe-xuan ，ZHAOJing—ya (1_SchoolofAgricultureandBiology，ShanghaiJiaotongUniversity，Shanghai200240，China； 2．SchoolofBioscienceandBioengineering，SouthChinaUniversityofTechnology，Guangzhou510006，China) Abstract：Betaine plays an imporant role in plant responses to various environmental stresses． PhosphoethanolamineN—methyltransferas (PEAM T)isthekeyregulatory enzymein thebiosynthesis pathwayoftheprecursorcholine．Inthisstudy，afull—lenghcDNA ofPEAMT gene(namedL6PEAMT) wasfirstlyisolatedandcharacterizedfrom theleavesofL．barbarum．FulllengthLbPEAMT was1808 bp，containinga1497bpORF andencoding498amino acids．Comparativeandbioinformaticsanalyses revealedthattheaminoacidsequenceencodedbythisgene(L6PEA^T)washighlyhomologous(93 )to PEAMTsfrom otherplantspecies (i．e．，tomato)．Thepredicted second structureofthis