无核小枣4cl基因的克隆及生物信息学分析.docVIP

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2018-01-17 发布于天津
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无核小枣4cl基因的克隆及生物信息学分析.doc

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无核小枣木质素合成基因的克隆和表达分析裴艳梅王金鑫彭建营河北农业大学园艺学院保定摘要为研究无核小枣果实无核形成机理应用扩增技术从无核小枣果实中克隆得到香豆酸辅酶连接酶基因的完整编码区序列长度包含的完整开放阅读框编码个氨基酸命名为登陆号与基因组序列比对分析发现该基因组含有个外显子个内含子其序列比对和结构域分析表明无核小枣的基因包含基因家族的和保守区进化树分析显示与苹果的亲缘关系最近实时荧光定量分析表明无核小枣在花后左右基因表达量达到最大值到花后以后表达量明显下降关键词无核小枣木质素基因基因克隆实时

无核小枣木质素合成基因Zj4CL的克隆和表达分析裴艳梅，王金鑫，彭建营（河北农业大学园艺学院，保定 071000）摘要:为研究无核小枣果实无核形成机理，应用RT-PCR扩增技术从无核小枣果实中克隆得到4-香豆酸辅酶A连接酶(4-Coumarate:Coenzyme A Ligase,4CL)基因的完整编码区，序列长度1819bp，包含1776bp的完整开放阅读框，编码591个氨基酸，命名为Zj4CL(登陆号KP279930)。Zj4CL与基因组序列比对分析发现，该基因组含有5个外显子，4个内含子。其序列比对和结构域分析表明，无核小枣的4CL基因包含4CL基因家族的Box I和Box II