Q TRAP系统的LIT扫描模式.docVIP

Q TRAPTM系统的LIT扫描模式 本指南包括线性离子阱（LIT）的各种扫描模式。该方法采用TurboIonSpray 离子源，正离子模式检测，用注射泵直接进样。GluFibrinopeptide B标准溶液的配制参见附录。 增强型全扫描（EMS） EMS是一种标准的离子阱扫描方式。离子源产生的离子通过四极杆（RF ohly），进入离子阱。离子阱充满后，离子沿轴向扫描输出到达检测器。 增强多电荷扫描（EMC） EMC是一种标准的离子阱扫描方式，可用来提高多电荷离子的信噪比。离子源产生的离子通过四极杆（RF ohly），进入离子阱。离子阱充满后，单电荷离子从离子阱中排空，主要留下多电荷离子。然后，离子沿轴向扫描输出到达检测器。 增强分辨率扫描（ER） 这种扫描方式可以获得感兴趣离子的高分辨MS。第一个质量扫描四极杆（Q1）设定质量窗口为感兴趣离子的左右6-8amu。离子被贮存在离子阱中，在一个较窄的质量范围（~20amu）内以低扫描速度（250amu/sec）扫描输出。这种扫描方式可以得到~0.15amu FWHM峰宽。 增强型子离子扫描（EPI） EPI用于获得特定离子的高品质的MS/MS谱。在碰撞室中发生裂解，从而提供丰富的MS/MS碰撞诱导裂解信息。在这种模式下，先在Q1中选择母离子，质量窗口宽度为1-4amu，滤掉其它所有的离子。母离子在Q2碰撞室中发生碰撞诱导裂解（CAD）。产生的碎片离子被离子阱捕获；然后根据碎片离子分辨率的要求，以三种扫描速度中的一种扫描输出。 MS/MS/MS扫描 MS/MS/MS扫描可用于获得特定MS/MS离子的进一步的信息，在这种模式下，先在Q1中选择一级母离子，质量窗口宽度为1-4amu，该离子在碰撞室中发生碰撞诱导裂解（CAD）。产生的碎片离子进入离子阱中，其中一个碎片离子被选择性地分离出来（分离的宽度为1-5amu）。分离之后，该离子被一个单波长激发频率所激发（激发宽度~1Da）发生裂解（激发能量可以由用户控制）。产生的碎片离子被离子阱捕获；然后以三种扫描速度中的一种扫描输出。 时间延迟碎裂扫描（TDF） 这种扫描方式可以简化MS/MS谱的低质量区。TDF扫描之后，低质量区主要为y-离子，因而这种扫描方式是确定多肽de novo序列的有力工具。在TDF模式下，离子在Q2和Q3之间的低压区域被击活。由于低压，被击活离子弛豫速率降低。能量较高的离子（能够产生次级碎片离子，使低质量部分的图谱复杂化）将快速裂解不在离子阱中贮存。能量较高的碎片离子将贮存在离子阱中，在TDF扫描中占据图谱的低质量区。 母离子被碰撞击活后，贮存在离子阱中并在指定的时间内（Q3 cool time）发生裂解。质量低于Q3 fill mass的碎片离子从离子阱中甩出。经过Q3冷却后，全质量范围的离子被贮存在离子阱中。然后，贮存在离子阱中的离子扫描输出。 离子阱MS/MS扫描 MS/MS扫描也可以采用MS/MS/MS扫描功能在离子阱中执行。在这种模式下，先在Q1中选择母离子。不加碰撞能量，如多肽的质量可在离子阱中选择和分离。现在，加在多肽上的激发能是其在离子阱中裂解。这些碎片离子然后以三种扫描速度中的一种扫描输出。 Q0 Trapping Q0 Trapping可以在大多数扫描方式中打开以增加扫描的灵敏度。Q0 Trapping打开时，离子源产生的离子在Q0中富集同时线性离子阱在扫描。当离子阱准备再次充满时，离子从Q0中释放。 4.1 创建硬件Profile 点击导航栏(屏幕的左边)中的Hardware Configuration，打开Hardware Configuration Editor，点击New Profile创建一个新的硬件Profile并命名为“MS+syringe”。选择Add Device 并从外围设备列表中选出Mass Spectrometer。点击OK使其出现在Edit Profile窗口。点击Setup Device并检查小窗口下端box确保use integrated syring pump被击活。点击OK回到Hardware Configuration Editor。 回到Hardware Configuration Editor之后，点击Active Profile。电脑将与Profile中的设备建立通讯，checkmark变绿。关闭编辑器。 4.2 注射进样GluFibrinopeptide B 从菜单Tune中选择projectsCreate project 创建一个新的project，命名为Training。硬件Profile被击活后，点击导航栏(屏幕的左边)中的Tune，然后点击T图标使仪器进入“Ready”状态。此时可听到气打开仪器被击活。 双击导航栏中的Man