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基于QSPR研究绿原酸类化合物与血清白蛋白的结合-中药信息工程
2012 第十四卷 第四期 ★Vol.14 No.4
基于QSPR 研究绿原酸类化合物与
血清白蛋白的结合*
□高 静 张燕玲 乔延江 **
(北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市“中药基础与新药研究重点实验室” 北京 100102)
摘 要:本文选取 32 个 小分子化学成分和 9 个天然产物化学成分为训 练集 ,利 用 Dragon 软件计
算分子描述符 ,应 用 WEKA 软件 中 CfsSubsetEval 评价方法和 BestFirst-D1-N5 搜 索方法进一步 筛选描
述符 ,利 用 Linear Regression 方法建立 了分子结构与其血清蛋 白结合 常数值 logK 的定量结构-性质相
关性模型(相关 系数 为 0.9557)。应 用该模型对 10 个绿原酸类化合物的 logK 进行预测 ,结果显示绿原
酸的 logK 预测值 为 4.51 ,与文献报道的 logK 值在 4~7 范 围 内基本相符 。研 究结果为进一步探讨绿原
酸与血清蛋 白的结合情况提供指导 ,为研 究药物与血清蛋 白的结合提供 思路。
关键词:分子描述符 线性回 归模型 绿原酸 血清 白蛋 白
doi: 10.3969/j.issn.1674-3849.2012.04.005
绿原酸( Chlorogenic acid, CA) 是由咖啡酸和奎 原酸以半抗原形式存在,本身不具有致敏性,但它与
尼酸生成的缩酚酸,是植物细胞在有氧呼吸过程中 血清蛋白结合形成复合物能产生免疫原性,从而引
经莽草酸途径的中间产物合成的一种苯丙素类化合 [4]
起过敏反应 。所以研究绿原酸与血清蛋白的结合情
物,是一种具有重要生物活性的小分子物质,主要存 况对于其过敏反应的研究具有一定的指导意义。
在于金银花、栀子等药材中,具有广泛的药理作用, 血清蛋白是人体内含量最丰富的蛋白质,负责
如抗菌、抗病毒、保肝利胆、抗肿瘤、降血压、降血脂、 身体内各种内源与外源性物质的转运,对它们的分
清除自由基和兴奋中枢神经系统等,被认为是抗菌 布与沉淀有重要作用。当药物被吸收后,进入循环
解毒、消炎类中成药的主要有效成分,且通常被作为 系统,许多药物会与血清蛋白发生较强的、可逆的
定性定量的指标。但从20 世纪60 年代开始国内外 结合,生成游离型和结合型的药物,通常游离型药
的专家学者就对绿原酸是否是致敏原存有争议,至 物具有药理活性,而结合型药物不能进行被动转运
[1~3] [5]
今依然没有得出确切的研究结论 。有研究表明绿 而失去其药理活性 。
定量结构- 性质关系(Quantitive Structure Prop -
收稿日期 :2012-07-09 erty Relationship, QSPR)研究在于建立化合物定量
修 回 日期:2012-08-13
* 北京 中医药大学 自主课题 (2011-CXTD-11):中药信息 工程 ,负责人 :乔延江 ;北京 中医药大学 自主课题 (2011-JDJS-12):活血化瘀 中药治
疗冠心病 的作用机制研 究,负责人 :张燕玲;教 育部博 士点基金 (20092213120006):基 于花生四烯 酸代谢途径 的清热解毒 中药有效成分信
息辨识研 究,负责人 :张燕玲。
** 通讯作者 :乔延江 ,本刊编委 ,教授 ,博士生导师,北京 中医药大学副校长,主要研 究方向:中药信息工程 ,中药质量控制 ,Tel :010,E-
mail :yjqiao@263.net 。
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