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第二章 分类阶元,第三章特征分析PPT
第二章 分类阶元; 分类阶元 分类单元
科Family 蝉科Cicadida
亚科Subfamily 蝉亚科Cicadinae
族Tribe 蚱蝉族Cryptotympanini
属Genus 蚱蝉属Cryptotympana
种Species 蚱蝉C.atrata (Fabr.)
分类阶元有20多个,但常用的有17个左右,按其作用一般分为三类:
基本阶元:种
主要阶元:界、门、纲、目、科、属、种
次要阶元:在阶元间所加的总(super-)或亚(sub-)
或者分为种上阶元、种下阶元和种三类。;二、基本阶元 种及其概念;1;二、基本阶元 种及其概念;三、种下阶元;三、种下阶元;三、种下阶元;三、种下阶元;四、种上阶元;四、种上阶元;四、种上阶元;四、种上阶元;第三章 分类特征及其分析;二、分类特征的类型及应用;4、地理分布特征
种群间同域性和异域性关系,对于决定两个
种群能否代表两个种具有重要的意义。
;二、分类特征的类型及应用;二、分类特征的类型及应用;三、特征分析;(一)、一般统计学方法的应用;(一)、一般统计学方法的应用;(一)、一般统计学方法的应用;(二)、数值分类分析法
1、特征数值化
只有数值化后才能在计算机上进行数学运算。根据特征的不同类型,数值化的编码也不同。一般可分为以下几类:
数值特征:体长、数量、比例、生理生化数值等
二态特征:“1、0”或“+、-”,“Nc”(缺项)
有序多态特征:刻点、刺等
无序多态特征:膜翅、鳞翅、半翅、缨翅等 ;(二)、数值分类分析法
2、编制原始数据矩阵
X=(Xi j)M*N
M为OTU (operational taxonomic units)数,
N为特征数
Xi j为第i个OTU的第j个特征的原始数据
3、原始数据的标准化
一般用标准差标准化(正规化)
;(二)、数值分类分析法
4、建立相似性系数矩阵
5、建立分类结构、编制相似性程度树形图
;(三)、支序分类分析法
首先要判别特征的极性,其次是支序分析,最后是支序图的建立。
特征极性的判别原则:
化石顺序、外群比较、群类系列对比、类群趋势和个体发育等
1、Hennig法;A;2、支序数值分析法
Kluge Farris法
举例:设有A、B、C、 D 4个种级分类单元及其共同祖先ANC(A-D)特征状态如下:
分类单元 特征矩阵
ANC(A-D) 0 0 0 0 0
A 0 0 1 1 0
B 0 0 0 1 0
C 0 1 1 1 1
D 0 0 1 1 1
祖种是根据外群比较法得知的,因此有关特征状态均为0。首先计算各分类单元与祖种间的距离。;
D(A,ANC)=|0-0|+|0-0|+|1-0|+|1-0|+|0-0|=2
D(B,ANC)=|0-0|+|0-0|+|0-0|+|1-0|+|0-0|=1
D(C,ANC)=|0-0|+|1-0|+|1-0|+|1-0|+|1-0|=4
D(D,ANC)=|0-0|+|0-0|+|1-0|+|1-0|+|1-0|=3
其中D(
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