玄参3种栽培类型遗传关系和遗传多样性的srap研究.pdfVIP

第 34 卷第 2 期 Vol.34 ，Issue 2 2009 年 1 月 January ，2009 玄参 3 种栽培类型遗传关系和遗传多样性 的 SRAP 研究 1* 1 1 1 2 陈大霞 ，李隆云 ，彭 锐 ，吴叶宽 ，蔡应繁 （1. 重庆市中药研究院，重庆 400065 ；2. 重庆邮电大学，重庆 400065 ） [摘要] 目的：从分子水平上研究玄参3 种栽培类型的遗传关系和遗传多样性。方法：对玄参3 种不同栽培类型的 92 个 单株进行 SRAP 分析。运用 POPGENE version 1.31 软件计算相关参数，采用 UPGMA 聚类法进行聚类分析。结果：①20 个 SRAP 引物共扩增出 227 条带，其中有 119 条呈多态性。②玄参 3 种不同栽培类型的遗传多样性居中等水平。在物种水平上， 多态位点百分率 PPB=52.42% ，平均每个位点的有效等位基因数 Ne=1.281 2 ，Nei’s 基因多样性指数 H=0.167 1 ，Shannon’s 多样性信息指数H =0.252 6 。在栽培类型水平上，PPB=21.44 % ，N =1.121 6 ，H=0.072 5 ，Shannon’s 多样性信息指数H = sp e pop 0.108 3 。③Nei’s 基因多样性指数计算的栽培类型间遗传分化系数（0.562 5 ）与Shannon’s 栽培类型分化系数（0.571 3 ）基 本一致，均说明大部分遗传变异存在于栽培类型间。④栽培类型间基因流为 0.388 9，说明栽培类型间基因流动较少，遗传 分化程度较高。⑤两两栽培类型间的 Nei’s 遗传一致度（I ）的范围为0.808 2~0.913 3 。根据Nei’s 遗传距离进行各类型间的 UPGMA 聚类，基于 SRAP 分子标记的聚类结果与形态分类基本一致。结论：栽培玄参的遗传多样性居中等水平，且栽培类 型间的遗传差异大于栽培类型内的遗传差异。 [关键词] 玄参；栽培类型；SRAP；遗传差异 ∗ 玄 参 为 玄 参 科 植 物 玄 参 Scrophularia 年从湖南引进，由重庆市中药研究院李隆云研究员 ningpoensis 的干燥根，应用历史悠久，是我国传统 鉴定。根据均匀分布、随机取样原则进行采样，尽 常用中药之一。目前我国玄参药材大多为栽培，栽 量覆盖该类型的整个栽培范围。采样时间为 2006 培范围广泛，类型多样，经过长期的相互引种交 年 8 月，GZ 型和 HLa 型各取 30 个单株，HLb 取 流，造成了地区间玄参类型的混杂。不同栽培类型 32 个单株，所采个体之间至少间隔 20 m 。采集植 之间的遗传差异与药材的产量是否相关，亟待研 株上的健康幼嫩叶片，低温下带回实验室洗净、晾 究。本研究对重庆市武隆天生药业玄参规范化种植 干，用于 DNA 提取。 （GAP ）示范基地的3 种不同栽培类型进行了形态 1.2 仪器与试剂 Gel Doc 2000 凝胶成像系统 调查，并采用新型的 SRAP 标记从分子水平上剖析 （BIO-RAD ），Eppendorf Mastercycler® gradient 梯 其遗传差异，为科学合理地保护和利用现有的野生 度 PCR 仪（Eppendorf ），Smart SpeeTM3000 型分 玄参