落羽杉属不同种及其杂交后代的srap分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学,2011年,第30卷,第1112-1119页 Genomics and Applied Biology, 2011, Vol.30,1112-1119 数据分析 An Analysis 落羽杉属不同种及其杂交后代的 SRAP 分析 於朝广 殷云龙 徐建华 江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园), 南京, 210014 通讯作者: yucg168@; 作者 基因组学与应用生物学, 2011 年, 第 30 卷, 第 18 篇 DOI: 10.5376/.2011.30.0018 收稿日期：2011 年 3 月 11 日 接受日期：2011 年 4 月 18 日 发表日期：2011 年 5 月 9 日 这是一篇开放阅取的论文，其论文发布和传播接受《Creative Commons Attribution License》所有条款。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人 允许和同意第三方无条件的使用、传播以及任何媒介的复制或再制作。 建议的引用格式如下： 於朝广等, 2011, 落羽杉属不同种及其杂交后代的 SRAP 分析, 基因组学与应用生物学, Vol.30 No.18 (DOI: 10.5376/.2011.30.0018) 摘 要 利用 61 对已筛选好的 SRAP 引物对落羽杉属树木 3 个种及 3 个变种和 19 个杂交后代共 25 份材料进行扩增，并 分析其亲缘关系，构建指纹图谱。结果表明：61 对 SRAP 引物在25 份参试材料中共扩增出 439 个清晰的标记位点，其中多 态性位点数为 356 个，多态性比率为 81.09%，每对引物产生的多态性位点的百分率在 33.33%~100%之间，说明落羽杉属不 同种及变种和杂交后代间在DNA 水平上存在广泛的遗传变异。25 份材料间遗传相似系数(GS)的变异范围为0.498 6~0.807 6， 平均遗传相似系数为 0.646 1 。落羽杉、池杉和墨杉 3 个种的遗传距离较远，遗传差异较大。从聚类结果来看，同一个杂交 组合的后代相似系数较高，亲缘关系较近，基本上都聚在了一起，同时也出现了一些遗传差异较大的后代，如中山杉 46 、 102 和 149。从 61 对 SRAP 引物的扩增图谱可以看出，有 16 个材料可通过一些特异性标记有效地与其它材料区分开来， 25 份材料均可以通过不同引物组合构建的指纹图谱加以区分。本研究结果为落羽杉属树木种质的收集、利用及育种提供了 理论依据。 关键词 落羽杉属; SRAP-PCR; 亲缘关系; 纹图谱 SRAP Analysis of the Different Species and Hybrids of Taxodium Yu Chaoguang Yin Yunlong Xu Jianhua Institute of Botany, Jiangsu Province and Chinese Academy of Sciences, Nanjing, 210014 Corresponding author: yucg168@; Authors Abstract We amplified 25 samples including 3 species, 3 varieties and 19 hybrids of Taxodium using 61 pairs of filtered SRAP primers, analyzed their genetic relationship, and constructed their fingerprinting map. The results showed that a total of 439 clear marker sites were amplified from 25 samples using 61 pairs of primers, and in which 356 were polymorphic sites, the polymorphism is 81.09%. The percentage