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研一章 基因、基因组与基因组学 医学分子生物学
2. 逆转录(reverse transcription): 是指在逆转录酶的作用下以RNA为模板合成DNA的过程。 3. 逆转录病毒基因组复制过程 在逆转录过程中,新合成的DNA链要发生两次“跳跃”(jump),以改变链间碱基配对的位置,使双链DNA的两端产生相同的长末端重复序列LTR (long terminal repeats)。 LTR: 逆转录形成的cDNA在末端形成了新的重复序列U3-R-U5 LTR中含有整合信号、转录信号( U3区启动子)、增强子和poly A位点等序列 逆转录病毒复制转录均需经过DNA中间体完成。 DNA中间体—原病毒 转录出5’R-3’R区 —gag基因mRNA; 90%翻译gag蛋白; 10%越过gag基因终止密码,翻译pol基因,并被酶切割形成衣壳蛋白、逆转录酶、整合酶。 有一部分转录后剪接,使env基因编码区和5’帽结构连接形成mRNA,翻译出病毒包膜的糖蛋白 第三节 基因组学 研究内容 人类基因组及人类基因组学进展 一、基因组学研究内容 (一)结构基因组学(structural genomics): 通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。 包括: 遗传图谱(cM厘摩RFLP,STR,SNP; 连锁的遗传标志之间重组频率,确定距离); 物理图谱( STS序列标志位点确定距离);(酶切后探针标记杂交) 转录图谱(EST表达序列标签mRNA3’UTR特异,RH(放射杂交)定位构成);测序。 (二)功能基因组学 (functional genomics) 又称后基因组学(post-genomics),利用结构基因组所提供的信息和产物,发展和应用新的实验手段,通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能。 包括 基因组表达及调控的研究 (mRNA与蛋白质相互关系); 人类基因信息的识别和鉴定 (生物信息学、计算计算机、生物实验学); 基因功能信息的提取和鉴定 (突变体系统鉴定、表达谱绘制、Pr水平修饰及相互作用); 测序和基因多样性分析(SNP)。 (三)比较基因组学 (comparative genomics) 基于基因组图谱和测序基础上,对已知的基因和基因组结构进行比较,来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科。 利用模式生物基因组与人类基因组之间编码序列上和结构上的同源性,克隆人类疾病的基因,揭示基因功能和疾病分子机制,阐明物种进化关系及基因组的内在结构。 二、人类基因组及人类基因组学进展 (一)人类基因组计划 了解整个基因组所有基因 (二)人类基因组计划的研究进展: 1.人类基因总数在3万个到3.5万个之间 2.基因组中存在着基因密度较高的“热点”区域(17,19,22号染色体密度高;X,Y,4,18号密度小 )和大片不携带人类基因的“荒漠”区域 3.大约1/3以上基因组包含重复序列 4. 所有人都具有99.99%的相同基因,而且不同人种的人比同一人种的人在基因上更为相似?;每个人都有自己的一套SNP(个性) (三)我国HGP的历史和现状 第四节 基因组的复制 基因组全部序列的复制是完整、真实的传递生物体内全部遗传信息的必要条件 复制过程 一、各种基因组复制的共同机制和不同特点 (一)不同基因组DNA复制的共同机制和不同特点 1.不同基因组DNA复制的共同机制: ( 1 )基因组DNA都有固定的复制起始点 ( 2 )复制过程中形成复制泡和复制叉 ( 3 )复制的基本单位称为复制子 ( 4 )半保留复制方式保证遗传信息的忠实传递 ( 5 )半不连续复制方式克服了DNA空间结构对DNA新链合成的制约 2.不同基因组DNA复制具有不同特点: ( 1)真核生物基因组DNA复制过程中涉及到逆转录 端粒复制 ( 2 )基因组单链DNA通过复制中间体完成复制 DNA病毒 ( 3 )有的基因组DNA需要通过RNA中间体进行复制 DNA病毒 ( )双链环状DNA也有不同的复制方式 D型复制、滚环复制等 (二)不同基因组RNA可通过不同的模式进行复制 1.基因组双链RN
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