基于文献报道的中药化学成分与CYP450s相互作用研究＊.PDFVIP

2015　第十七卷　第一期　★Vol.17 No.1 基于文献报道的中药化学成分与 CYP450s 相互作用研究＊ 1 2 1 2 1 1 ＊＊ 雷　蕾 ，王新洲 ，杨　策 ，朱永亮 ，张　黎 ，崔　蒙 （1.…中国中医科学院中医药信息研究所　北京　100700；… 2.苏州润新生物科技有限公司　苏州　215123） 摘　要 ：目的：使用复杂网络技术研究中药化学成分与CYP450s 的关系，为中药分子机理研究和新药开 发提供参考。方法：本文基于 120 篇文献报道，通过人工摘录的方式收集中药化学成分和CYP450s 的相关 信息，使用Cytoscape 2.8.2 作为分析工具，构建化学成分与CYP450s的复杂网络图，并计算了点度中心度、 接近中心度、中间中心度以及中药化学成分节点的相似度。结果：本文采集了 169 个中药化学成分和25 种 CYP450s 的相关信息。CYP2C19、CYP1A2、CYP3A4 等CYP450s 和槲皮素、银杏内酯A 、黄芩素等化学成分 为目前研究的热点酶和热点中药化学成分。相似度较高的欧前胡素和银杏内酯B ，槲皮素和黄芩素等化学 成分可能存在协同相互作用。结论：复杂网络计算可以很好地辅助中药协同作用机理研究和新药开发工作。 关键词 ：复杂网络计算　CYP450s　中药化学成分　相似度计算 doi: 10.11842/wst.2015.01.003　　中图分类号：R285.1　　文献标识码：A CYP450s为血红蛋白类酶，是微粒体混合功能 CYP450s相互作用的数据，使用复杂网络算法研究 氧化酶系中最重要的一族氧化酶，它参与机体内大 它们之间的相互关系，从而辅助研究中药协同代谢 部分外源性、内源性物质的代谢。CYP450s主要 机理，为新药开发提供参考。 存在于生物体肝脏微粒体内，也分布于胃肠道、肾、 1　材料与方法 [1] 脑、皮肤、肺及胎盘等组织器官 。近年来，天然产 物尤其中药对CYP450s的作用越来越受到人们的 1.1　资料来源 [2,3] 本文选择中国知网（CNKI）的中国学术期刊 关注 。中药成分复杂，由中药引起的代谢性药物 相互作用的原因大多缘于中药化学成分影响了机 网络出版总库（China…Academic…Journal…Network… 体CYP450s活性或者机体CYP450s蛋白表达，导 Publishing…Database，简称CAJD）、万方数据服务平 致由CYP450s参与代谢的其它药物在机体内代谢 台、中国生物医学文献数据库（CBM）和中国中医药 特征的改变，因此中药化学成分与CYP450s的相 期刊文献数据库为期刊科技论文信息检索来源，检 [4] 索关于中药化学成分与CYP450s相关的所有文章， 互作用研究逐渐成为热门领域 。如果将中药化 学成分和CYP450s都作为节点，它们之间的关系 包括研究文献、综述等共285篇，排除对CYP450s 看作边，那么形成的复杂网络就具有一定的特点和 无明显作用和无活性的相关报道，共得到120篇… 规律。本文基于文献报道的关于中药化学成分与 文献。 1.2　研究方法 首先，将120篇文章中的中药化学成分和 　　收稿日期：2014-08-04 　　修回日期：2014-08-25 ＊　 国家自然科学基金委面上项目）：中药对细胞色素P450 酶作用及配伍减毒的计算预测，负责人：崔蒙。 ＊＊ 通讯作者：崔蒙，硕士，博士研究生导师，主要研究方向：中医药信