合成生物学重点专项2018项目申报.pdfVIP

“合成生物学”重点专项 2018 年度项目申报指南 （征求意见稿） 合成生物学以工程化设计理念，对生物体进行有目标的设计、 改造乃至重新合成。“合成生物学”重点专项总体目标是针对人 工合成生物创建的重大科学问题，围绕物质转化、生态环境保护、 医疗水平提高、农业增产等重大需求，突破合成生物学的基本科 学问题，构建几个实用性的重大人工生物体系，创新合成生物前 沿技术，为促进生物产业创新发展与经济绿色增长等做出重大科 技支撑。 2018 年本专项将围绕基因组人工合成与高版本底盘细胞、人 工元器件与基因线路、人工细胞合成代谢与复杂生物系统、使能 技术体系与生物安全评估等4 个任务部署项目。 1. 人工基因组合成与高版本底盘细胞构建 1.1 原核生物基因组的人工设计与合成 研究内容：针对大肠杆菌等模式原核生物，开展人工基因组 的理性设计与化学合成研究。发展原核基因组深度设计、化学再 造的新方法和新技术；进行基因组的系统简化和高度简约基因组 的人工合成、组装与功能分析。 考核指标：建立人工基因组的模块化、适配性、正交性、成 簇化的基本原则；创建大肠杆菌基因组设计合成与定制化重塑的 1 方法；实现 2-3 种重要代谢通路等特殊功能的再造；化学全合成 基因组3.5 Mb 以上。 1.2 真核微生物基因组的人工设计与合成 研究内容：针对真核模式生物酿酒酵母等，建立真核生物基 因组的设计新原则和组装新策略，发展真核染色体深度设计再造 与功能重塑的新方法和新技术；化学全合成深度设计酵母基因组， 研究真核基因组简化的规律。 考核指标：建立酿酒酵母人工基因组深度设计合成的新原则； 建立酵母基因组的模块化组装和人工基因组精简的新策略；合成 再造的酿酒酵母基因组精简20% ；化学全合成染色体10 Mb 以上。 1.3 高版本模式微生物底盘细胞 研究内容：以解决生命科学研究中重大科学问题为导向、以 重要微生物为对象，提升其研究性能或拓展其研究与应用范围而 进行微生物比较与进化基因组分析，或系统与定量生物学分析， 实现生理或遗传的数字建模或/和“底盘化”细胞的理性设计、 编辑、重构及相关研究。 考核指标：针对重要微生物的研究目标，建立多层次基因组 结构功能分析体系或模块化微生物数字细胞，实现较强的预测能 力；建立相应的全基因组及特殊基因模块的理性设计体系；实现 基因组改造与重编程以及基因表达的精细调控；构建 4-5 种在所 设计的生物学功能上具有显著超越现有天然细胞的人工高版本底 盘细胞，并进行相关功能测试。其中，1-2 种人工底盘细胞在科 研应用中获得突破性进展。 2 1.4 微藻底盘细胞的理想设计与系统改造 研究内容：研究微藻底盘细胞设计、开发通用技术和工具， 实现微藻基因组的编辑、大片段删减和功能模块的稳定表达；研 究微藻细胞代谢和生理功能模块, 再设计、组装和适配高效的生 物合成与调控功能模块；研究微藻底盘细胞的逆境适应机理，提 升其适应力，开展合成微藻的工程化示范。 考核指标：建立聚球藻、鞘丝藻、微拟球藻等可工程化微藻 的高效遗传操作与基因组编辑改造技术，构建2 种以上基因组简 化、具有多重可调控基因回路、可编程控制产物积累的新型微藻 底盘细胞；实现 1-3 个微藻代谢和生理功能模块的鉴定、重构， 开发 3-5 种重要能源化工产品和高值天然产物的生物合成与调控 模块，突破天然生物合成的调控和效能限制，实现目标产品的高 效固碳合成；鉴定、设计8-10 种可移植型微藻抗逆功能元件，获 得可在大规模培养条件下应用的微藻底盘细胞和细胞工厂，实现 合成微藻制造的工程化示范 。 1.5 高版本工业放线菌底盘 研究内容：研究外源复杂生物合成途径在放线菌底盘中的适 配机制（包括产物对底盘耐受，底物供给与辅酶平衡，合成元件 的翻译后修饰等机制），开发人工蛋白骨架技术以及高效率多靶 点的基因编辑技术，构建基于多组学分析和体外重建系统的网络 模型，将放线菌底盘服务于新产物挖掘和药物高产。 考核指标：建立针对聚酮、萜类、核糖体肽、氨基糖苷等产 物