林麝MHC-DRA基因分析及与反刍亚目DRA基因比较-四川动物.PDFVIP

四川动物２０１４年 第３３卷 第４期　　　　　　　　　　　　　　　　　ＳｉｃｈｕａｎＪｏｕｒｎａｌｏｆＺｏｏｌｏｇｙ　Ｖｏｌ３３　Ｎｏ４　２０１４ ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１０００－７０８３．２０１４．０４．００１ 林麝ＭＨＣＤＲＡ基因分析及与反刍亚目ＤＲＡ基因比较 １，２ １ 夏珊 ，岳碧松 （１四川大学生命科学学院，四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室，成都６１００６４； ２成都师范学院化学与生命科学学院，成都６１１１３０） 　　摘要：ＭＨＣＤＲＡ基因仅在少部分物种如马、斑马、驴等具有多态性，ＤＲＡ基因在其他哺乳动物中多为低多态 性。由于ＭＨＣＤＲＡ的低多态性，较少受到研究者重视，我们选取近缘物种牛的ＤＲＡ基因引物，对四川养麝研究所 的２１７只林麝进行ＤＲＡ基因ｅｘｏｎ２的序列扩增，得到２个林麝ＤＲＡ基因，片段长度为２６０ｂｐ，这２个基因仅有一个 核苷酸同义突变，没有氨基酸突变。我们将所获得的林麝ＤＲＡ基因与反刍亚目其他物种ＤＲＡ基因进行氨基酸比 对发现，我们扩增的序列为林麝ＤＲＡ基因ｅｘｏｎ２，编码 ＭＨＣ 类分子的 １区域，而这段区域主要参与形成ＭＨＣ Ⅱ α Ⅱ类分子的多肽结合槽，根据Ｂｒｏｗｎ确定人类的抗原肽结合区位点，在参与比对的反刍亚目物种ＤＲＡ基因中，抗原 位点１１、２２、７２、７６存在氨基酸变异，而在这些位点上林麝的ＤＲＡ基因没有变异，和大部分反刍亚目相同。同时我 们发现大部分反刍亚目物种之间氨基酸突变的位点大都在非抗原结合位点。 关键词：林麝；ＭＨＣ；ＤＲＡ；反刍亚目 中图分类号：Ｑ９５９８；Ｑ７８　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１０００－７０８３（２０１４）０４－０４８１－０６ ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＦｏｒｅｓｔＭｕｓｋＤｅｅｒ（Ｍｏｓｃｈｕｓｂｅｒｅｚｏｖｓｋｉｉ）ＭＨＣＤＲＡＧｅｎｅＥｘｏｎ２ａｎｄ ＣｏｍｐａｒｅｄｗｉｔｈＯｔｈｅｒＲｕｍｉｎａｎｔｉａ １，２ １ ＸＩＡＳｈａｎ ，ＹＵＥＢｉｓｏｎｇ （１．ＳｉｃｈｕａｎＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＣｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎＢｉｏｌｏｇｙｏｎＥｎｄａｎｇｅｒｅｄＷｉｌｄｌｉｆｅ，ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＳｉｃｈｕａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ， Ｃｈｅｎｇｄｕ６１００６４，Ｃｈｉｎａ；２．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＣｈｅｍｉｓｔｒｙａｎｄＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅ，ＣｈｅｎｇｄｕＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈｅｎｇｄｕ６１１１３０，Ｃｈｉｎａ） 　Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅｍａｊｏｒｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙｃｏｍｐｌｅｘ（ＭＨＣ）ｉｓｏｎｅｏｆｔｈｅｍｏｓｔｉｍｐｏｒｔａｎｔｅｌｅｍｅｎｔｓｉｎｉｍｍｕｎｅｓｙｓｔｅｍｉｎａｌ ｍｏｓｔａｌｌｖｅｒｔｅｂｒａｔｅｓ．ＭａｍｍａｌｓｕｓｕａｌｌｙｓｈｏｗｌｏｗＭＨＣＤＲＡｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｗｉｔｈｔｈｅｅｘｃｅｐｔｉｏｎｏｆｈｏｒｓｅ，ｚｅｂｒａａｎｄｄｏｎｋｅｙ． ＣａｔｔｌｅｓｐｅｃｉｆｉｃｐｒｉｍｅｒｓＤＲＡＦａｎｄＤＲＡＲｗｅｒｅｕｓｅｄｔｏａｍｐｌｉｆｙａ２６０ｂｐｆｒａｇｍｅｎｔｏｆｅｘｏｎ２ｏｆｔｈｅＤＲＡｌｏｃｕｓｆｒｏｍｇｅｎｍｏｎ  ｉｃＤＮＡｏｆ２１７ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓｏｆＣｈｉｎｅｓｅｆｏｒｅｓｔｍｕｓｋｄｅｅｒ．Ｗｅｆｏｕｎｄ２ａｌｌｅｌｅｓｏｎｌｏｃｕｓＤＲＡａｎｄｎａｍｅｄｔｈｅｍａｓＭｏｂｅＤＲＡ １  ａｎｄＭｏｂｅＤＲＡ ２．Ｔｈｅｒｅｗａｓｏｎｌｙｏｎｅｎｕｃｌｅｏｔ