约束调控结点的基因网络构建算法-电子测量技术.PDFVIP

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约束调控结点的基因网络构建算法-电子测量技术

电 子 测 量 技 术 第 卷 第 期 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理论与算法 理理论论与与算算法法 年 月 约束调控结点的基因网络构建算法 刘 飞 宝鸡文理学院物理与光电技术学院 宝鸡 摘 要从实验数据构建基因调控网络是计算生物学领域的一个研究热点但是启发式搜索基因最大父结点数量限 制策略和条件最优搜索等构建方法的计算复杂度都较大启发式搜索方法的缺陷众所周知在启发式搜索策略中很 少有人限制基因结点的父结点数量且搜索结果为了达到最优使得算法的时间复杂度变得很高通过理论分析和实 验结果说明了最大父结点数量选取问题的优点和缺点然后利用最优搜索方法融合最大父结点数量选取优点和已知 基因调控网络拓扑信息提出了新的基因调控网络构建方法该方法利用贝叶斯网络框架实现并在不同规模和拓扑 结构的生物分子数据真实网络数据和计算机人工合成数据集上进行测试实验结果显示该方法比现存的最优搜索 算法有更快的计算速度 关键词贝叶斯网络网络构建基因调控网络计算复杂度 中图分类号 文献标识码 国家标准学科分类代码

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