畜禽基因组选择研究进展_张哲.pdfVIP

2011 年 第 56 卷 第 26 期：2212 ~ 2222 《中国科学》杂志社 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 畜禽基因组选择研究进展 * 张哲, 张勤, 丁向东 中国农业大学动物科技学院, 农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室, 畜禽育种国家工程实验室, 北京 100193 * 联系人, E-mail: qzhang@ 2011-03-08 收稿, 2011-06-09 接受 引进国际先进农业科学技术计划(2011-G2A, 2010-C14)、国家自然科学基金、转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08009- 146B)和中国农业大学研究生科研创新专项资助 摘要 基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择, 也是一种标记辅助选择. 此方法能够 关键词 在提高育种值估计准确性的同时, 通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展. 随 基因组选择 着畜禽高密度全基因组 SNP 芯片的问世, 基因组选择方法正在影响着传统的畜禽遗传评估体 基因组育种值 系. 在多数奶业发达国家, 基因组选择方法正逐渐取代传统奶牛遗传评估方法, 成为奶牛遗传 标记辅助选择 畜禽 评估的“标准”方法. 近年来, 针对基因组选择的方法、影响因素、应用策略和育种方案的研究 育种 大量涌现. 基因组选择已经成为当前动物、植物及水产生物遗传育种领域的研究热点. 本文综 述了基因组选择的计算方法、准确性的来源及影响因素以及基因组选择在畜禽遗传育种中的应 用现状, 同时对当前存在的问题进行总结, 并对基因组选择的理论发展和应用前景进行展望. 畜禽的多数重要经济性状都是数量性状. 传统 高密度全基因组SNP (single nucleotide polymorphism, 的畜禽育种工作使用表型和系谱记录, 通过最佳 单核苷酸多态)芯片已经面市. 为了将高密度全基因 线性无偏预测(best linear unbiased predication, BLUP) 组标记信息更有效地用于遗传改良, Meuwissen 等 来估计育种值(estimated breeding values, EBVs), 人[2]于 2001 年首次提出了基因组选择(genomic se- 并在此基础上进行选择, 从而实现对畜禽重要经济 lection, GS)方法. 近年来, 针对基因组选择的计算方 性状的遗传改良. 此方法已经在畜禽遗传改良中 法、影响因素、应用策略和育种方案的研究大量涌现. 取得了很大进展, 如通过使用传统育种手段, 美国奶 在第9 届遗传学应用于畜牧生产世界大会(9th World 牛的平均产奶性状在过去的40 年间增加了 5000 kg, Congress of Genetics Applied on Livestock Production, 其中有至少 60% 的贡献来自遗传改良. 但是, 对于 Leipzig, Germany)上, 有超过三分之一的报告与基因 一些遗传力低的性状的限性性状、长寿性状以及表 组选择有关[3]. 这充分说明基因组选择方法已经成为 [1] [4] [5] 型难以测定或测定成本较高的性状来说却进展缓慢. 世界畜禽 、作物 和水产生物 遗传育种领域新的 近年来, 随着分子遗传学的发展, 遗传标记逐渐用 研究热点. 目前, 中国也已经