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国立交通大学物理研究所-国立交通大学机构典藏
國 立 交 通 大 學
物理研究所
碩 士 論 文
記憶效應對 mRNA 轉譯過程噪聲分解的影響
The memory effect on the noise decomposition
during mRNA translation
研 究 生:黃冠智
指導教授:張正宏 副教授
中 華 民 國 一百零三 年 七 月
記憶效應對 mRNA 轉譯過程噪聲分解的影響
The memory effect on the noise decomposition
during mRNA translation
研究生:黃冠智 Student: Guan-Jhih, Huang
指導教授:張正宏 Advisor: Cheng-Hung Chang
國 立 交 通 大 學
物理研究所
碩 士 論 文
A Thesis
Submitted to Institute of Physics College of Science
National Chiao Tung University
In partial Fulfillment of the Requirements
For the degree of
Master
In
Physics
July 2014
Hsinchu, Taiwan, Republic of China
中國民國一零四年七月
記憶效應對 mRNA 轉譯過程噪聲分解的影響
研究生:黃冠智 指導教授:張正宏
國立交通大學物理研究所碩士班
中文摘要
在生活中處處存在著噪聲(noise) ,而如何分析這些噪聲的來源是相當重要的。我
們使用 dual-reporters 的方法將噪聲拆解成內部與外部噪聲 ,並分別以當下環境
的狀態和環境的歷史為條件將 mRNA 轉譯成 protein 過程中的噪聲拆解 ,並利用
variance norm 與 KL_divergence 來了解當下的 protein 與此不同時間之前 mRNA 的
關聯 。
由上述方法得知,在大部分的情況下,只考慮當下環境的狀態為條件做拆解時,
並不能正確的拆解噪聲,而必須考慮所有環境的歷史才能精確的拆解內外噪聲 ,
不過在特殊的狀況下:如在 mRNA 的耗散速率遠大於 protein 的耗散速率時,以
當下環境的狀態就能得到相當好的拆解 ,且環境歷史的影響程度會因為在不同的
速率常數下各不相同 。
關鍵詞:擾動 、噪音 、分解
i
The memory effect on the noise decomposition
during mRNA translation
Student: Guan-Jhih, Huang
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