酶学-2011-2.ppt

二、酶分子的模体 在蛋白质的结构中模体(motif)是由数 十个氨基酸组成的具有一个相对独立功能的小区，一个结构域可包括数个模体，如催化结构域可包括能和几种不同底物相结合的模体，调节结构域也可含有与不同调节物结合的模体。但有的模体也可独立存在而不属于某个既定的结构域。;20个氨基酸的一字符： G,A,V,L,I,P, C,M, T,S D,E Q,N, F,Y,W, H,R,K, Q,W,E,R,T,Y,I,P,A,S,D,F, G,H,K,L,C,V,N,M; 具有相同或类似的酶常含有相同的模体， 如所有以ATP为底物的蛋白激酶在催化结构域中有一个22~27肽的区段，GXGXXGX15~20K，称为ATP结合模体。另一类合成酶如氨基酰-tRNA合成酶虽也以ATP为底物，但其ATP结合模体为HIGH。; 蛋白激酶C（PKC）的N端1/2肽段为调节结构域，常规型PKC（包括α、βⅠ、βⅡ、γ四种亚型或同工酶）含有3个与酶活力调节有关的模体（图-2）：;①假底物模体PS，其中心肽段为RK(或R.Q)GAL (或I、V、R)R六肽，与被PKC磷酸化的底物的肽段RXXSXR基本相同，只是第4位的Ser（磷酸化位点）换以Ala，故不能被自身催化而成为假底物。;; ③钙结合模体CaBS,DG对酶的激活需要 Ca2+的存在，因Ca2+和钙结合区结合后可加强 酶的激活。新型PKC(δ、ε、η、θ、μ亚型)由于缺乏CaBS模体而不受Ca2+激活，但仍受DG及磷脂激活。PKC的C端1/2为催化区域，除有ATP结合模 体（图-2中的ABS）外，尚有蛋白质结合模体 （PBS）和催化位点AspPheGly(DFG)。; 弗林蛋白酶（Furin）是一种蛋白质前体加工酶,它借跨膜结构定位于外侧高尔基体网络(TGN) , 也可存在于细胞膜及胞外基质中。但它在胞外的停留十分短暂，可通过胞饮作用而重新返回TGN。;弗林蛋白酶的胞质结构域中有两个分开的四肽模体和酸性模体，前者是位于762~765位的YKGL，后者为774~783的CPSDSEEDEG。 ; 四肽模体在人、鼠、牛来源的弗林蛋白酶中完全保守，且普遍存在于各种能通过胞饮途径循环于细胞膜与高尔基体之间的膜蛋白中，它们都处于相距跨膜结构域20~30氨基酸残基的胞质区。 ; 酸性模体也可能在酶定位于膜结构中起作 用。因为一些膜蛋白，如运铁蛋白受体、表皮生 长因子受体、低密度脂蛋白受体乃至溶酶体的酸 性磷酸酶中也存在这类酸性模体，说明具有不同 功能的酶只要有某一相同或相似的性能，就可能 存在这类同源性的酸性模体。;另一有趣的例子是磷脂酶A2、磷脂酶C、蛋白激酶C和GTP酶活化蛋白（GAP）等都可和膜结合与受钙激活，都含有高度同源的Ca2+依赖性膜连接模体。 ;三、酶的活性中心 （一）活性中心必需基团的概念（17501） 酶蛋白的催化结构域中和底物结合并发挥催 化作用的部位，称为酶的活性中心，是酶显示 活性直接相关的区域。;参与活性中心的化学基团实际上就是酶蛋白氨基酸残基的侧链，有时尚包括肽链末端的基团。这些基团在一级结构上并不互相毗邻，而往往分散在氨基酸残基序列中，甚至分布在不同的肽链上。 ; 故活性中心和模体不同，模体中的氨基酸 残基一般在一级结构上是顺次相连的，而活性中心则要依靠酶分子的二、三级结构，即肽链的卷曲、折叠，包括形成肽链间的二硫键，才使这些互相隔离的基团靠近，集中在酶分子表面而形成具有三维结构的特定区域。;如胰凝乳蛋白酶活性中心含有Ilel6、His57、Asp102、Asp194和Ser195（序号以酶原为准），它们在酶原形成时分散在一条肽链上，但酶原经胰蛋白激活后，形成A，B，C三条肽链，前三个残基在B链，后两个在C链。 ;; 在空间结构上已互相接近，形成Asp102、 His57和Ser195线性排列。在活性中心的基团中， 有的担负和底物结合的作用，称为结合基团，有 的可能参与使底物转变成产物，称为催化基团， 但有时结合基团也参与催化作用。;另外、还有一些辅助基团，起辅助催化基团的作用。如电子或质子的转移等。A0220001; 酶活性中心的一些化学基团为酶发挥催化 作用所必需，故称为必需基团。但在酶活性中心 以外的区域，尚有不和底物直接作用的必需基团，称为活性中心外的必需基团。;这些基团与维持整个酶分子的空间构象有关，可使活性中心中各有关基团保持于最适的空间位置，间接地对酶的催化活性发挥其必不可少的作用，有人称之为结构基团（或残基）。 ; 然而，在酶的催化域中还存在一些不属于活性中心或结构基团的残基，称为