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非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体(egfr)基因突变检测方法建立和临床应用word论文
优秀毕业论文
精品参考文献资料
摘 要
肺癌的发病率和死亡率居于恶性肿瘤的首位,其中约 80%是非小细胞肺癌
(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)。分子靶向治疗被认为是治疗晚期 NSCLC 的主要方法,而表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor, EGFR)则是目前最主要的靶点,但临床上使用的 EGFR 靶向药物并非对所有患 者都有效, EGFR 敏感突变则是药物有效的前提。2011 版的 NCCN 非小细胞肺 癌指南中明确指出,晚期 NSCLC 患者应先检测 EGFR 基因的突变状况,若有 EGFR 基因敏感突变,优先推荐 EGFR-TKI 治疗。外周血循环 DNA 因具备肿瘤 细胞 DNA 的一些特征,并且取材方便、创伤小和能实时检测而成为临床研究的 热点。本论文主要分以下两部分内容。
第一部分,人 EGFR 基因突变检测方法的建立。 目的:建立一种能够快速、敏感、特异、简便检测人 EGFR 基因突变的方法。 方法:首先,利用分子克隆技术及 Fast Mutagenesis System 原理,联合质粒
连接、转化构建人 EGFR 基因的 4 种野生型和 29 种突变型质粒,并将构建质粒
的测序结果与 NCBI 数据库的序列进行比对。
其次,采用 Primer Express 3.0 软件设计人 EGFR 基因 29 种突变质粒的 ARMS 特异性引物及检测目的序列的 Taqman 水解探针,并经过反复实验筛选、确定, 进而确定、优化反应体系及确定判定标准并验证其检测灵敏度、特异性、检测限。
最后,用所建方法检测 100 例临床石蜡组织样本的 EGFR 基因并根据划定的
判读标准判读结果,然后与焦磷酸测序结果进行比对,验证该方法的可行性。
结果:①构建完成的人 EGFR 基因的 4 种野生型和 29 种突变型质粒的序列 与 NCBI 数据库序列完全一致,即完成质粒构建。
②最终筛选并确定的ARMS引物和Taqman探针能够进行特异性扩增,即PCR 产物的电泳结果显示全部为目的大小的条带。已建方法的检测灵敏度、特异性和 检测限达到检测要求,最后划定的Cutoff △Ct值见表10。
③所建方法及确定的判读标准检测 100 例临床石蜡组织样本得到的结果和 焦磷酸测序结果完全一致,该法可行。
结论:本研究建立的 PCR-荧光探针法是一种灵敏、特异、简便的人 EGFR
基因突变检测方法,有实用参考价值。
III万方数据
III
万方数据
第二部分,探究所建方法检测外周血 EGFR 基因突变临床应用的可行性。
目的:通过对晚期 NSCLC 患者的配对组织和血浆中的循环 DNA 进行 EGFR
基因突变检测,探究所建方法检测血浆 DNA EGFR 基因突变临床应用的可行性。
方法:从 50 例晚期 NSCLC 患者的肿瘤组织和血浆中提取 DNA,使用已 建的 PCR-荧光探针法对其进行 EGFR 突变检测,评估两样本中基因突变的一致 性。
结果:50 例肺癌临床样本,在外周血样本中:检出 S768I 1 例, T790M 1 例, L858R 4 例, Ins 1 例, Del 5 例,共计突变 12 例,总突变率为 24%;在 石蜡组织样本中:检出 S768I 2 例, T790M 1 例, L858R 6 例, Del 5 例,共 计突变 14 例,总突变率为 28%;其中有 3 例组织样本能检测到突变而配对外周 血样本不能,有 1 例外周血样本能检测到突变而配对组织样本不能;两样本 EGFR 基因突变的一致性为 92%。
结论:血浆循环 DNA 与相对应的肿瘤组织 DNA 的 EGFR 基因突变类型一 致性较高,部分 NSCLC 患者的肿瘤组织难以获得,这种简便且微创地检测血浆 循环 DNA 的方法很有可能取代组织而应用于肺癌 EGFR 基因突变的诊断,从而 指导临床治疗。
本论文突出之处:本论文将 ARMS 技术和 Taqman 技术结合,建立了实验室 快速检测人 EGFR 基因的突变检测方法,而且探究了该法对外周血 DNA 检测的 适用性,为以后临床应用打下了基础。
关键词: 非小细胞肺癌; 表皮生长因子受体; 基因突变; 扩增阻滞突 变系统; 循环 DNA
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万方数据
ABSTRACT
Lung cancer is a malignant tumor with the highest incidence and mortality, and in the cases of lung cancer, non-small cell lung cancer (Non-Small Cell Lung Cancer,
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