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基因克隆的一般流程
基因的获得
PCR
RT-PCR
载体
连接
准备感受态细胞
转化
重组子筛选
下游工作
载体的选择
基因工程载体一般要求:
能在宿主细胞中复制繁殖,有较高的自主复制能力。
易进入宿主细胞,进入效率越高越好。
合适的多克隆位点(MCS)可接受外源片段,且不影响其进入宿主细胞和在细胞中的复制。
易从宿主细胞中分离纯化出来, 便于重组操作。
有筛选标志,当其进入宿主细胞、或携带着外源序列进入宿主细胞都能容易被辨认和分离出来。便于克隆操作。
常用的载体有质粒、噬菌体和病毒等
重组 DNA 技术的一般流程
目的DNA的获得
目的DNA与载体的连接
重组子导入受体细胞
重组子的筛选和鉴定
实验一:pEGFP-NGF质粒载体的构建
NGF 基因的克隆(T-A克隆)
NGF-sense: a GAGCTC aagatgctgtgcctcaagccagt
NGF-antisense: at GGGCCC gtctagatcc agagtgtctg
5
6
pEGFP 荧光质粒表达载体
质粒DNA的酶切反应结果
质粒 M 酶切反应 M 酶切反应
pEGFP pT-NGF
酶切产物凝胶回收操作步骤(Gel Extraction Kit)
仔细切下含DNA的凝胶,置一称重的1.5ml离心管中。称重。
按300lS1溶液/100mg凝胶加入的比例加入S1溶液,置50℃水浴10分钟,使凝胶完全溶化,每2分钟颠倒混匀一次。
将溶化后的凝胶溶液移入吸附柱,置收集管中,9000g×30秒,倒掉收集管中的液体,再将吸附柱放入同一收集管中。
在吸附柱中加入500l W1溶液,9000g×15秒,倒掉收集管中的液体,再将吸附柱放入同一收集管中。重复一次洗柱。
将吸附柱放入同一收集管中。9000g×1分钟。
将吸附柱放入一新1.5ml离心管中,在吸附膜中央加入30lddH2O,静置1分钟,9000g×1分钟。备用。
重组子的筛选
耐药性基因
外源质粒赋予宿主抗生素抗性
蓝白斑筛选(互补现象)
lacZ+ plasmid 和 M15△ cell strain
不匹配粘端连接图示
连接反应的建立
连接反应的温度:
粘性末端,按A-T,G-C含量计算,±5℃。
如 Pst I(CTGCA↓G,12℃ ),EcoRI(G↓AATTC,8℃)。
平末端,如EcoRⅤ(GAT↓ATC),可在室温进行,不超过30℃,酶的用量要比粘性末端加大10-100倍 。
DNA量:
摩尔数之比 载体:目的 DNA = 1 : ( 1~3 )
载体摩尔数 目标基因片段碱基数×载体重量
目标DNA摩尔数 目标基因片段重量×载体碱基数
载体和目标基因的连接反应
如未定量可以按回收效率75%计算DNA浓度,按载体与目的基因摩尔数比1:3进行连接。
连接反应在灭菌的0.5ml离心管中进行。15 l体积反应体系中:
加ddH2O使终体积为 15 l
Liner vector 50-100 ng
Target gene fragment 15- 30 ng
10×Ligase Buffer (已含有ATP) 1.5 l
T4 DNA Ligase 1.O l
轻轻混匀,稍加离心, 14-16℃或4℃,O/N 。
重组子转入受体细胞
体外重组的DNA引入受体细胞
感受态:受体细胞处于易于接受外源 DNA 的状态
原理:(1)遗传物质的传递
(2)受体菌的选择与改造
重组质粒的酶切鉴定
重组子的鉴定
插入片段长度大小鉴定
质粒抽提、酶切;PCR
插入片段方向性鉴定
可以选择基因内部切点进行不对称酶切
DNA序列测定
荧光质粒转染观察
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