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R软件入门练习 练习1 下载并安装R软件1下载并安装R软件 2了解R的菜单练习2 安装并导入R程序包 1安装程序包 程序包从本地zip文件安装程序包 2调用程序包 library(vegan) library(ape) 练习3 查看帮助文件 1打开ape软件包的帮助文件 帮助Html帮助Packagesape 2 导入ape程序包 library(ape) 3查找ape包中plot.phylo函数的帮助 ?plot.phylo 4 将其中的Example文件粘贴到Console中，查看运行的结果。练习4 查看boxplot的帮助文件 1在控制台中输入 ?boxplot 2查看最后的examples 将帮助文件中的examples粘贴到控制台中，运行并观看运行结果。 3更改参数 boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays, col = lightgray) boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays, col = red, xlab=spray , ylab=counts) 练习5 数据读取和t检验 1 将表2中的数据录入Excel中，另存为t.test.txt文件(参考 t.test.data.txt)。 2 数据的读取 data-read.table(路径/t.test.data.txt,header=T) 3 比值的计算 bmi-weight/height^2 4 t检验 t.test(bmi, mu=22.5) #t检验 5 绘图 plot(height, weight) # 绘图 6 更改绘图的参数 plot(height, weight, pch=2) #更改后的绘图 练习6 方差分析和箱线图的绘制 1 在excel中准备数据表，另存为 .txt文件，制表符间隔 （参考 anova.test.data.txt） 2 用R读取数据表 bac-read.table(d:/anova.test.txt,header=T) 3 将ba数据框中的type转换为因子(factor) as.factor(bac$type) 4 方差分析 ba.an-aov(lm(day~type,data=bac)) 5 显示方差分析结果 summary(ba.an) 6 绘制箱线图 boxplot(day~type,data=bac,col=red) 练习7 因子生成 1 将100,200,200,200,400,600,600,600,800 输入R中，保存到numeric对象中 numeric-c(100, 200, 400, 600, 800) 2 将numeric转换为factor factor.numeric-as.factor(numeric) 3 查看factor.numeric的内容 factor.numeric 练习8 条件筛选 1 创建一个2到50的向量,形式为 2, 4, 6, 8, ..., 48, 50并名为为vector1 vector1-seq(from=2, to=50, by=2) 2 选取vector1中的第20个元素 vector1[20] 3 选取vector1中的第10，15，20个元素 vector1[c(10,15,20)] 4 选取vector1中的第10到20个元素 vector1[10:20] 5 选取vector1中值大于40的元素 vector1[vector140] 练习9 了解工作路径 1 查看当前R工作的空间目录 getwd() 2 将R工作的路径设置为 d:/data/ setwd(“d:/data”) weight height 4.17 1.75 5.58 1.8 5.18 1.65 6.11 1.9 4.5 1.74 4.61 1.91 5.17 1.75 4.53 1.8 5.33 1.65 5.14 1.9 4.81 1.74 4.17 1.91 4.41 1.75 3.59 1.8 5.87 1.65 3.83 1.9 6.03 1.74 4.89 1.91 4.32 1.75 4.69 1.8 2 方差分析数据 day type 2 a 4 a 3 a 2 a 4 a 7 a 7 a 2 a 5 a 4 a 5 b 6 b 8 b 5 b 10 b 7 b 12 b 6 b 6 b 7 c 11 c 6 c 6 c 7 c 9 c 5 c 10 c 6 c 3 c 10 c