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[理学]基础分子生物学课件

Chapter 5 编码区指的是基因上能代表蛋白序列的那部分。 DNA的编码链与mRNA的序列是一样的。 双链DNA的模板链是指用于确定互补单链RNA的那条链(非模板链与RNA产物的序列相同). 转录是指以DNA为模板合成RNA。 翻译是指以RNA为模板合成蛋白质。 tRNA由74-95个碱基组成, 形成带有4个恒定臂的三叶草二级结构(在更长的tRNA中另有一个臂). tRNA用于与氨基酸结合并形成氨酰-tRNA. 其具体步骤是: 将接受臂末端的腺嘌呤核苷酸基团的2′或3′羟基与氨基酸上的羧基结合起来, 从而形成酯键. 三叶草二级结构形成了L形三级结构, 一端是接受臂, 另一端是反密码子. tRNA折叠为紧凑的L形三级结构, 其一端为氨基酸, 另一端为反密码子. 核糖体是用沉降系数来描述的(细菌的核糖体为70S, 真核生物的核糖体为80S). 核糖体包括大亚基(在细菌和真核生物中分别为50S和60S)和小亚基(在细菌和真核生物中分别为30S和40S) 核糖体提供了合适的环境, 可以使氨酰-tRNA根据对应的三联体密码子, 将氨基酸加入到正在合成的蛋白质上. 核糖体沿着RNA的5 3 方向移动. 一个核糖体包括两个亚基. 一条mRNA可同时由几个核糖体翻译. 每个核糖体则处于mRNA上的不同位置. 一条多聚核糖体包括一条正在翻译的mRNA和几个同时由5 ′ 3 ′移动的核糖体. 每个核糖体包括两个tRNA分子, 一个携带新生蛋白质, 另一个携带下一个待加的氨基酸. 在细菌中, 转录和翻译是同时进行的, 在mRNA和合成尚未结束时, 它的翻译已经开始了. 细菌的mRNA是不稳定的, 其半衰期只有几分钟. 细菌的mRNA是多顺反子, 有几个编码区, 分别代表不同的基因. 细菌RNA包括了转录区和非转录区. 每个编码区有自己的起始子和终止子. 一个典型的mRNA包括了几个编码区. 真核生物细胞mRNA是在转录时或转录后的短时间内在细胞核内被修饰的. 修饰包括在5 ′端甲基化的加帽和在 3 ′端加一条多聚腺苷酸序列. mRNA只有在修饰全部完成后才能从细胞核内被转运到细胞质中. 真核生物细胞的mRNA是在5 ′端加帽, 3 ′端加多聚腺苷酸. 真核生物细胞的mRNA需要转录, 修饰, 加工, 核质运输和翻译. 5 ′端加帽是通过5 ′ 5 ′键把一个G加到转录物的末端碱基, 随后, 1-3个甲基基团被加到新的末端鸟嘌呤的碱基或核糖上. 帽子覆盖了mRNA的5 ′端, 它可在几个位点被甲基化. 约200个腺嘌呤被加到细胞核中的转录物尾部. poly(A)被特异的蛋白质PABP结合. poly(A)有助于稳定mRNA, 防止降解. Poly(A)+ RNA 能够用琼脂糖-oligo(dT)将它从其他RNA中分离出来. 细菌mRNA的降解方向大多为5 ′ 3 ′. 降解由两部分组成: 核酸内切酶的切割, 以及核酸外切酶对这些片段从3 ′ 5 ′方向的降解. 细菌mRNA的降解分两步. 核酸内切酶5 ′ 3 ′方向跟随核糖体切割, 切下来的片段由核酸外切酶由从3 ′ 5 ′方向切割. mRNA两端的修饰防止它被核酸外切酶降解. mRNA中的特异序列可影响它的稳定/非稳定性. poly(A)的缺失可能引发非稳定性. 酵母mRNA的降解需要5 ′端加帽和3′端poly(A)的移除. 酵母的其中一条通路与5 ′ 3′核酸外切酶的降解有关. 另一条酵母通路使用由几个核酸外切酶所形成的复合体, 它沿着3 ′ 5 ′方向发挥作用. 动物细胞的脱腺苷酸化酶可能直接结合在5 ′端帽子上. 脱腺苷化引发脱帽反应, 它能够使核酸外切酶从5 ′端切割. 脱腺苷化可直接导致从3′端开始的核酸外切酶与核酸内切酶的切割. 无义突变引发mRNA降解. 我们已经在酵母和线虫里发现了编码降解系统的基因. 无义突变引发mRNA降解. RNA以核糖核蛋白颗粒形式运转. 所有在细胞质中起作用的真核生物细胞RNA都要从细胞核转运出来. tRNA和核酸酶的RNA组分被转运入线粒体. mRNA在植物细胞之间能够被长距离转运. 酵母的Ash1 mRNA形成核糖核蛋白, 结合于马达肌球蛋白上. 马达沿着肌动蛋白微丝将Ash1 mRNA转运到芽孢子细胞里. Ash1 mRNA在芽孢处锚定并翻译, 所以蛋白也仅仅在芽孢处被发现. 复习题 原核mRNA的结构? 真核mRNA的结构? This structure is called a cap. It is a substrate for several methylation events. Figure 5.18 shows the full structure of a cap after all possible me

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