[生物学]序列分析1.pptVIP

序列的相似性 序列的相似性 一致性(identity): 两个蛋白质有一定数量的氨基酸在排比的位点上是相同的，即如果38个氨基酸的蛋白质中15个位点相同，我们说它们一致性为39.4%. MSDTPSTGFSIIHPTSSEGQVPPPRHLSLTHPVVAKRISFYKSG -------------PRNGTIKIYENPARTFTRPYSAKNITIYKEND 所以, 相似性的数值一定比一致性的要( ) 大 or 相等 or 小 生物序列的同源性 同源性(homology)： 指从一些数据中推断出的两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论，属于质的判断。 就是说A和B的关系上，只有是同源序列，或者非同源序列两种关系。而说A和B的同源性为80％都是不科学的。 序列比较的基本操作是比对（Alignment） 两个序列的比对是指这两个序列中各个字符的一种一一对应关系，或字符的对比排列 。 编辑距离（Edit Distance) 字符编辑操作（Edit Operation） 字符编辑操作可将一个序列转化为一个新序列 Match（a，a） Delete（a，-） Replace（a，b） Insert（-，b） 相似度，它是两个序列的函数，相似度越大，表示两个序列越相似 距离, 距离越大，则两个序列的相似度就越小 最长公共子序列 (L