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[医学]H7_真核基因表达的调控好
大肠杆菌的σ70 在大肠杆菌中,最常见的调控因子是由rpoD基因所编码的σ70。 由rpoH编码的σ32是与热休克启动子所控制的基因转录密切相关。 由rpoN编码的σ54则参与细胞的氮代谢。 由T4噬菌体所编码的σ55能与大肠杆菌RNA聚合酶的核心酶结合,启动T4晚期基因的转录。 原核生物扩展的启动子 核心启动子 -35区:RNA聚合酶识别位点(R site),松弛结合 -10区: RNA聚合酶紧密结合位点(B site) +1位点:转录起始位点 上游控制因子:-70~-40,含有与CAP-cAMP结合位点,正调控转录。 真核基因转录基本条件 编码蛋白质的基因转录的基本条件包括 启动子(特别是核心启动子) 转录模板(转录起始点(+1)---终止点) RNA聚合酶Ⅱ 普通转录因子(GTFs) 真核生物启动子 真核生物的启动子的位置:一般位于RNA聚合酶II转录起始点上游100-200bp以内,其功能是决定转录的起始点和调控转录频率。 真核生物启动子的结构 : 核心启动子: 上游启动子元件(Upstream Promoter element,UPE) 核心启动子(core promoter):是指保证RNA聚合酶II转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游-25?30bp处的TATA盒。核心启动子确定转录起始位点并产生基础水平的转录。 2、上游启动子元件(Upstream Promoter element,UPE) 上游启动子元件:真核生物的启动子位于TATA区上游的保守序列称为上游启动子元件或称上游激活序列(upstream activating sequence,UAS)。它们能较强影响转录起始的频率,如CAAT盒和GC盒。 真核基因的启动子在–70~–80区含有GCCAAT的保守序列,称为CAAT box。 真核基因的启动子在在CAAT盒两侧具有富含GC的保守的序列(GC box),称为GC盒或GC岛。 第七章 真核基因表达调控 7.1 真核生物基因组的复杂性 7.2 真核生物基因表达调控的复杂性 7.3 真核生物DNA水平上的基因表达调控 7.4 转录后调控 7.5 mRNA的细胞核的输出 7.6 mRNA的稳定性与基因表达调控 7.7 翻译调控 7.8 mRNA的定位 7.1 真核生物基因组的复杂性 一、真核生物基因组的复杂性 二、基因家族(gene family) 1、简单多基因家族 2、复杂多基因家族 (1)基因组大,基因多,存在大量重复序列, (2)多为二倍体, (3)大部分DNA与组蛋白和非组蛋白结合在一起; DNA很少裸露 (4)基因主要以单顺反子形式存在; (5)多数基因是断裂的; (6)存在基因家族 (7)基因表达的调控位点多,位置多样化; (8)许多基因需要转录后加工处理才表现活性 (9)转录后的RNA需要运出细胞核才能被翻译成为蛋白质 (10)部分基因组序列存在重排、扩增、丢失等规律性变化。 原核生物基因组结构特点 基因组很小,大多只有一条染色体 结构简炼 有重叠基因 存在转录单元多顺反子 二、基因家族(gene family) 1、简单多基因家族 简单多基因家族中的基因一般以串联方式前后相连,各成员之间的序列相同或几乎相同。如5SrRNA的基因,rRNA等 2、复杂多基因家族 复杂多基因家族各成员之间的序列相似性较高,但有一定的差异,功能也有一定的分化,即便基因排列在一起,但基因之间由间隔序列隔开,作为独立的转录单位。如海胆的复杂的组蛋白多基因家族。 7.2 真核生物基因表达调控的复杂性 一、染色体结构的修饰与真核基因的转录密切相关 二、真核基因表达以正调控方式为主 三、真核基因表达调控的环节多 四、真核细胞在分化过程中会发生基因重排、基因丢失与基因扩增 真核基因表达调控的环节多 DNA水平上的调控 转录水平的调控 转录后的加工,转运,mRNA稳定性 翻译水平的调控 翻译后的表达调控:蛋白质的加工、折叠、转运和降解 7.3 真核生物DNA水平的调控 一、染色质状态对基因表达的调控 二、DNA结构的规律性变化与基因表达调控 染色质的两种状态 修饰作用与染色质状态的关系 2.1.1 染色质的两种状态 按功能状态的不同可将染色质分为: (1)活性染色质(有转录活性) (2)非活性染色质(没有转录活性) 活性染色质的核小体发生构象改变,具有松散的染色质结构,从而便于转录调控因子和顺式用元件结合和RNA聚合酶在转录模板上滑动。 修饰作用与染色质状态的关系 组蛋白的乙酰化(与基因活化有关) 组蛋白的甲基化(与基因失活有关) DNA的甲基化(与基因失活有关) 二、DNA结构的规律性变化 与基因表达调控 基因的丢失 基因的扩增 基因
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