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[研究生入学考试]第2章生物信息学的计算机基础22

  2.1.5 数据库的保护   为了保证数据的安全可靠和正确有效,DBMS需要提供统一的数据保护功能。数据保护也称数据控制,主要指数据的安全性、完整性、并发控制和数据库恢复。 数据库的安全性是指保护数据库以防止不合法的使用所造成的数据泄漏、更改或破坏,安全性问题不是数据库系统所独有的,计算机系统都存在这个问题,只是在数据库系统中有大量数据集中存放,而且为许多用户直接共享和使用的宝贵信息资源,从而安全性问题更为突出。系统安全保护措施是否有效是数据库系统的主要性能指标之一。   数据库的完整性是指数据的正确性和相容性。DBMS必须提供一种功能来保证数据库中数据的完整性。这种功能亦称为完整性检查,即系统用一定的机制来检查数据库中的数据是否满足规定的条件。这些条件在数据库中称为完整性约束条件。必须注意,数据库的完整性和安全性是两个不同的概念。完整性是为了防止数据库中存在不符合语义的数据,防止错误信息的输人和输出。而安全性是保护数据库,防止恶意的破坏和非法的存取。   数据库是一个共享资源,可以由多个用户使用。因此需要这些并发的应用互不干扰。一种方式是让这些用户程序一个一个地串行执行,每个时刻只有一个用户程序运行,执行对数据库的存取。其他用户程序必须等到这个用户程序结束以后方能对数据库进行存取操作。在这种方式下,如果一个用户程序涉及大量数据的输人/输出交换,数据库系统的大部分时间将处于休眠状态。为了充分利用数据库资源,应该允许多个用户程序并行地对数据库进行存取。这样就会产生多个程序并发地存取同一数据的清况。若对并发操作不加控制就会访问和存储不正确的数据,破坏数据库的完整性。  数据库的并发控制机制可防止上述问题的发生,正确处理好多用户、多任务环境下的并发操作。   尽管DBMS采用了以上各种保护措施防止对数据库安全性和完整性的破坏,保证并发事务的正确执行,但是计算机系统中硬件的故障、软件的错误、操作员的失误以及故意的破坏仍是不可避免的。因此数据库管理系统必须具有把数据库从错误状态恢复到某一已知的正确状态的功能,这就是数据库的恢复。恢复通常采用建立数据库备份和数据库运行日志的方法。 2.1.6 数据库是高层应用的基拙   现今大多数的应用系统中都含有数据库,因此都可以被认为是数据库应用系统,数据库充当了高层应用的基础。按应用层次和深度由下至上,可以将它们大致分为3类:电子数据处理(EDP),管理信息系统(MIS)和决策支持系统(DSS)。下层系统为上层系统提供数据和其他分析依据,上层系统包含下层系统。层次越高,系统越复杂。 EDP一般只完成单项事务处理任务;MIS以提高信息处理效率和管理水平为目的,按事务功能对EDP作业进行综合、统一规划和全面协调;DSS则以管理科学、运筹学、控制论和预测论、数据挖掘等理论和方法为基础,以计算机技术和信息技术为手段,为决策者提供决策所需的信息资料,辅助进行决策活动。 在生物信息学领域,随着数据量的急剧增加,从海量的生物数据中提取信息乃至知识的需求日益迫切,越来越多的生物数据库已开始采用数据库的主流技术。例如,EBI使用了Oracle的数据库技术,GSDB采用了Sybase的数据库技术,OOTFD则采用了流行的面向对象数据库技术。 2.2 计算机网络与国际互联网 计算机网络: 计算机网络是由一组计算机和相关软件组成的复合系统,每台计算机具有自主功能,同时又通过相互连接实现信息交换、资源共享或协同计算。因此,计算机网络是计算机技术与通信技术相结合的产物,包括计算机软/硬件、网络系统结构以及通信技术等内容。 功能:信息通信(电子邮件、网上电话、视频会议等)、资源共享(程序、数据、设备等)、分布式处理 集中模式 优点:节约资源 大型关键应用,如UNIX,常用于金融行业的集中式处理系统。 专用服务器模式 优点:保密性、可靠性、安全性 缺点:利用率低、负荷量大、单点故障等 客户/服务器模式 优点:扩展性好、均衡负载等 缺点:结构复杂、管理困难、开发难度大等 中等规模的应用,如Netware,Windows Server 对等模式 优点:任意访问、构架简单等 缺点:无安全性、管理混乱、资源查找困难等 小型应用,如Windows 98 常见网络操作系统 Unix操作系统 特性:模块化的系统设计;逻辑化文件系统;开放式系统;Unix优秀的网络功能;优秀的安全性;对硬件要求低 Linux操作系统 特性:扩展支持所有Unix操作系统;真正多任务、多用户系统;内置网络支持;可运行于多种硬件平台;对硬件要求较低;有广泛应用程序支持;设备独立和安全;良好可移植性 Windows NT/Server 2000 特性:拥有文件及文件管理系统;优先级的多任务/多线程环境;支持对称的多机处理系统;拥有兼容于分布计算的环境 UNIX是唯

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