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- 2018-03-22 发布于江苏
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质粒DNA提取与鉴定
质粒DNA的提取与鉴定
目的
学习和掌握用碱变性法从大肠杆菌中提取质粒DNA的原理和方法,以及琼脂糖凝胶电泳鉴定质粒DNA的技术。
原理
质粒(plasmid)是一种独立的稳定的遗传因子,存在于细菌等细胞中。它们为双链、闭环的DNA分子,大小从1kb到200kb不等,具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数并表达所携带的DNA基因信息,但其复制和转录要利用宿主细胞编码的一些酶和蛋白质,而宿主在没有质粒时是可以正常生长的。因此,质粒是一种寄生性的自主复制子。
细菌质粒是基因工程中常用的基因载体,也是分子生物学中研究基因结构、功能及其复制、表达的好材料。
从大肠杆菌分离质粒的方法很多,碱变性抽提法是常用的方法之一,此法基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性差异而达到分离的目的。在pH高达12.6的条件下,染色体DNA的氢键断裂、双螺旋解开而变性;质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链未完全分离,当用pH4.8的Kac高盐缓冲液调节pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,以可溶性状态存在于液相中,而染色体DNA不能复性,形成缠绕的网状结构,与不稳定的大分子RNA、蛋白质等一起沉淀出来。
在抽提过程中,由于各种因素的影响,质粒DNA可能以三种形式存在:
共价闭环DNA(cccDNA),常以超螺旋形式存在;
开环DNA(ocDNA),此种
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